作者,Evil Genius 新的一周,主要这周开始世界杯开赛了,看比赛的时间多了一点,个人喜欢德国队,不知道大家对世界杯有没有兴趣。 今天的文章我们来分享一点新的内容。文章...
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作者,Evil Genius 好了,开始这篇的内容。 文章信息A topographic atlas defines developmental origins of cel...
作者,Evil Genius 阳了个阳,出门在外,注意保护自己。 本篇参考文章Effect of the intratumoral microbiota on spatial...
1.读入RNA velocity的loom文件,并提取spliced文件和unspliced文件 2.提取原有的用seurat做的UMAP的图。 3.将RNA velocit...
这一节画的图是比较新的,图中我用红色箭头标出的是pathway 注释信息(big annotation,自己想的,非专有名词),纵轴花花绿绿的标注是pathway的 注释(s...
方法来源于上面这篇文章,不得不说,这篇文章运用了非常多复杂的方法去阐述关注的科学问题,真不愧是出自Broad institute实验室的。我这里暂时只讲下文章中一种比较新颖的...
在文献中,我们经常能够看到这样的散点图。例如,通过RNA-seq或qPCR比较特定基因在不同分组样本中的整体表达水平。 与其称它们为散点图,其实它们是有独自名字的—蜂群图。当...
今天呢,分享一个软件,用来分析单细胞的时间动力学,也就是轨迹方面的内容,感觉是一个不错的分析点,分享分享。 分享的文章在scTour: a deep learning arc...
新的一周第一天,我们不整那些难的,来点小的绘图细节分析,如下图 这个图包括两部分,左图的画法很简单 这是只是需要设置一下alpha参数,就可以把没有该细胞类型的位置给暴露出来...