引 众所周知Python常用的版本有2.x和3.x,常常会引起版本问题。由于我在Linux系统中已经安装有Python3.x和对应的TensorFlow,现在遇到需要跑在Py...
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开始 这是运行DL4J示例所需的一切,并开始自己的项目。 我们建议你加入我们的 Gitter Live Chat。Gitter是你可以请求帮助和提供反馈的地方,但是在问下面我...
在对Keras框架的学习中,一个很大的难点就是数据的导入,尤其是当数据不能一次放入内存的时候,应该如何导入的问题。在Keras的官网,没有章节特意讲这个内容,而专门去找资料,...
想请教下你的云服务器配置
在阿里云上部署Tensorflow和Jupyter目的 1、搭建Tensorflow环境; 2、使用Jupyter进行开发; 3、代码上传github 成果 1、在阿里云上租用Linux服务器; 2、搭建python、ten...
怎么引用?有没有参考文献?
如何轻松构建物种系统发育树在常规的基因组分析中,当我们对某一物种的基因组进行从头组装与注释获得其的基本信息后,通常会想知道该物种与一些其他近源物种之间的进化关系,此时就需要构建不同物种之间的系统发育树...
我们都知道ChIP-seq生物信息分析流程主要涉及:数据过滤、序列比对、检峰、模体(motif)分析。其核心的问题是寻找可靠的motif,也即转录因子结合位点结合的序列特征。...
请问有没有可以替代PASA的,因为PASA依赖mySQL而centOS7貌似放弃mySQL了
使用MAKER进行基因注释(高级篇之AUGUSTUS模型训练)准备训练集和测试集 根据Augutus的官方教程,可靠的基因结构序列的要求如下: 提供基因的编码部分,包含上游几KB。通常而言,基因越多,效果越好,至少准备200个基因以上。...
输入文件的格式能否展示一下
染色体上画基因结构图分布图之gggenes2018-11-7 基因结构图绘制之gggenes 最重要的包参考链接补上 https://github.com/wilkox/gggenes 安装包 注意这里绘图需要将Rs...
基因结构图从本质上就可以看成方块,直线,箭头的组合 解析GFF文件 bioconductor上有一个GenomicFeatures包,里面有一个makeTxDbFromGFF...
基因名的注释是怎么显示的呢?如何又可以不显示?
看帮助文档学热图生成测试数据 画热图 微信公众号生信星球同步更新我的文章,欢迎大家扫码关注! 我们有为生信初学者准备的学习小组, ◀️ 想要参加我的线上线下课程,也可加好友咨询🔼 如果需要提...
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做科研的都知道开创性的工作自然意义重大,但那是可遇不可求。迅速跟进大牛们开创性的思路或者方法,结合自身的研究基础,做出类似的成果无疑是个高效的策略。 早些年的转录组可谓是典型...
在常规的基因组分析中,当我们对某一物种的基因组进行从头组装与注释获得其的基本信息后,通常会想知道该物种与一些其他近源物种之间的进化关系,此时就需要构建不同物种之间的系统发育树...
请问,一般文章中显示的扩张和收缩的红绿两色的数值是怎么获得的?
「基因组学」使用CAFE进行基因家族扩张收缩分析环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder,然后再安装CAFE 数据准备: 一共会分析mouse, r...