起源! 某天,我发现了Shiny这个东西,当时兴冲冲的尝试官网上各种各样的例子,最后发现这个东西似乎只能充当一个“玩具”。如果要在本地运行,它需要一个完整的R环境,这对相当一...
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总结的不错
BLOSUM矩阵的推导BLOSUM62是应用得最广的氨基酸替换矩阵,是BLAST中蛋白质序列比对的默认矩阵。 1. 如何下载替换计分矩阵 ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/...
BLOSUM62是应用得最广的氨基酸替换矩阵,是BLAST中蛋白质序列比对的默认矩阵。 1. 如何下载替换计分矩阵 ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/...
2018.9.7 星期四 多云 biolearn cd-hit 是用于蛋白质序列或核酸序列聚类的工具,根据序列的相似度对序列进行聚类以去除冗余的序列,一般用于构建非冗余...
我是用这个脚本导出的
安装DSSP过程中遇到的问题#简介 Dssp是用来模拟蛋白二级结构的插件,可以方便的利用Biopython调取,然而在使用过程中无法顺利进行,原因是系统内没有定义Dssp的path并正确连接dssp服务...
from Bio.PDB import DSSP, PDBParser
pdb_file = "/Users/Jack/Desktop/CoV_related/Model/Cov_S.pdb"
p = PDBParser()
structure = p.get_structure("Model", pdb_file)
model = structure[0]
dssp = DSSP(model, pdb_file)
for row in dssp:
if row[0] < 1000:
print(row[0], row[1],row[2], row[3], row[4], row[5])
安装DSSP过程中遇到的问题#简介 Dssp是用来模拟蛋白二级结构的插件,可以方便的利用Biopython调取,然而在使用过程中无法顺利进行,原因是系统内没有定义Dssp的path并正确连接dssp服务...
哈哈,我猜反思完了下次还会再这样,因为人性是难以改变的,但你愿意挺周围的人的声音,却可以帮你弥补这一问题,正确的做法是顺其自然,找到周围对自己天然有利的因素并加以利用
Apple Watch屏幕摔碎后对自己面对损失态度的反思2019年11月18日晚上,正当我起身收拾书包准备离开图书馆去健身时,不小心碰到了放在桌边角上的Apple Watch。只听哐当一生,Apple watch屏幕证明着地,落下...