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  • 你好,我添加刻度标签时,一直报错,p7+scale_x_continuous(breaks=c(0.75,1.75,2.75,3.75,4.75,5.75,6.75,7.75),labels=c(0.75,1.75,2.75,3.75,4.75,5.75,6.75,7.75)),错误: Discrete value supplied to continuous scale

    跟着Nature Genetics学画图:R语言ggplot2画折线图并添加误差线

    折线图添加误差线是非常常用的一种可视化方法,今天的推文介绍一下使用R语言的ggplot2作图的代码。模仿的是论文 Phased diploid genome assembli...

  • 请问,meta分析时,20篇文章的数据是分别dada2然后再合并起来?还是把所有的数据放到一起,一起进行dada2?

    微生物多样性qiime2分析流程(2)使用qiime2和dada2处理16S序列

    我不太确定这篇文档里还有没有打错的命令,代码建议参考:一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)[https://www.jianshu.com/p/725ee7...

  • 请问,在荟萃分析时,28篇文章的数据是分别进行Dada2然后在合并起来?还是把所有数据放到一起,直接一起进行dada2?

    扩增子分析:qiime2平台全流程分析

    Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform qiime2是扩增子数据分析的最佳平台之一,其提供...

  • 你好,请问一下,荟萃分析时,20篇文章的数据是每篇文章单独进行DADA2,最后再合并?还是把20篇文章的数据全放到一起,一起进行DADA2?

    Qiime2 (三)-DADA2降噪(Denoise)流程

    Dada 2 流程 DADA2数据处理不以序列相似度聚类,只进行去重(或相当于以100%序列相似度聚类),生成的是以ASV为单元的表格;Vsearch数据处理与Usearch...

  • 请问vsearch对特征表进行聚类这一步,是必须得吗?

    一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)

    之前写过一系列qiim2的教程都是零零散散的记录,里面也有不少命令打错的步骤给各位小伙伴造成了不少的疑惑,恰逢qiime2-2020.11发布,所以就在重新总结一次,这次稍后...

  • 你好,请问批量转化的命令是什么?没咋看明白?

    如何用fasq-dump解压SRA文件

    之前介绍了如何安装sratoolkit, 可以看我之前写的简书https://www.jianshu.com/p/188df05615c7[https://www.jians...

  • 请问一下,如何把横纵轴转换?

    使用pheatmap包绘制热图

    加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出

  • 你好,我是做分类预测的,请问最后的预测那个地方,如何把预测出来的结果改成预测率?比如预测出来的结果为有病,但是我现在不想要这个结果 ,需要它的预测率(就是0-1)之间的数字,,该咋做?

    机器学习:05. 随机森林之RandomForestRegression填补缺失值

    1. RandomForestRegression 所有的参数,属性与接口,全部和随机森林分类器一致。仅有的不同就是回归树与分类树的不同,不纯度的指标,参数Criterion...

  • 你好,请问在做随机森林分类时,最后预测那个地方,如何把预测出来的结果改成预测率?比如预测出来的结果为有病,但是我现在不想要这个结果 ,需要它的预测率(就是0-1)之间的数字,,该咋做

    分类算法 - 随机森林

    一、定义 上次我写了决策树算法,决策树可以解决分类问题,也有CART算法可以解决回归问题,而随机森林也和决策树非常类似,采用了CART算法来生成决策树,因此既可以解决分类问题...

  • 你好,请问分组箱线图,如何添加最大值最小值的线?加上去之后,为什么和中间的那条线不连接在一起?

    ggplot2 - 箱线图(Box - plot)

    简介 箱线图,顾明思义,是形状像箱子并展示一组或多组数据分布的统计图,被认为是一个优于柱形图的数据可视化方案,文章中指出了很多箱线图的优点。[%20https://www.n...

  • 你好,请问多组箱线图时,该怎么添加最大最小值的那条线?stat和geom中的width后的数值要保持一致才行,不然中间的那条线将会偏离箱体的中间,可是要保持一致的话,那最大值的那条线就太长了,所以,应该怎么弄?

    个人向ggplot2箱线图总结

    主要从如何看图、用图与作图三个方面来对箱线图进行理解和总结。 1、看图 如图所示,箱线图是将一组数据按照大小顺序排列后进行绘制的,包含6个数据节点,分别表示出数据的上边缘、上...

  • 你好,请问多组时,为什么stat和geom中的width参数要一致,否则线就偏离箱体,这是为什么?但要是参数一样的话,那最大值的线就长了。请问应该怎么弄?

    为什么你画的ggplot2箱线图没横线 哈哈

    不知道大家有木有发现,基础包画箱线图是这样的: 它是一张有横线的图。而用ggplot2作图时,莫得感情,莫得横线😕。 能不能把横线加上,能啊,搜。 顺便把颜色也加上好了。 参...

  • 你好,请问多组时,该怎么做?

    ggplot箱线图之如何添加最大值最小值线(whisker-ends)

    ggplot作为R语言画图的瑞士军刀,相比于基础的R包,语法更加易于理解和掌握,不需要掌握很多的命令就能画出整洁美观的图表。比方说用ggplot来画箱线图,首先我们可以这样操...