该教程分为2部分，第1部分在：miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】 到此时，原始...
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miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】 -
small RNA学习（六）：计算已知miRNA的表达量从这一篇开始，是我重复一篇文献的记录，我在第五周文献学习笔记中提到过。 1. 过滤adapter 在第二篇笔记中，我判断接头序列是从raw data中看的，虽然准确但花了一些...
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reads计数原理及featureCounts统计counts后的cpm和tpm计算摘录：生信技能树论坛 Kai statquest 要求：实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表...
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Perl One-Liners | Perl命令行学习2 -p和-n参数
Perl 命令行参数 -p和-n 【上集回顾】：上一次提到了-e参数，一般在使用perl的单行程序时都会加上-e参数。-e参数就是将后面引号内的内容当作perl代码执行。 这...
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small RNA学习（一）：GEO数据下载一般在转录组或者基因表达相关的文献中，末尾都会附上Accession Numbers，可以用这个编号在GEO(Gene Expression Omnibus)数据库上下载该研...
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samtools`markdup`操作的正确顺序
具体实例在5 一步法找基因变异流程samtoolsmarkdup操作的正确顺序 The first sort can be omitted if the file is al...
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Linux权限详解（chmod、600、644、666、700、711、755、777、4755、6755、7755）
权限简介 Linux系统上对文件的权限有着严格的控制，用于如果相对某个文件执行某种操作，必须具有对应的权限方可执行成功。 Linux下文件的权限类型一般包括读，写，执行。对应...
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说说 Python 正则表达式中，如何实现文本替换
我们可以使用正则表达式实现文本替换，即使用新的文本替换到正则表达式模式所找到的文本。利用 Regex 对象的 sub() 方法来实现，它需要传入两个参数，参数类型都为字符串。...
