主要想介绍的是下载下来数据的数据处理这一块，不是特别建议RTCGA的下载方法，列出了是因为怕没有源文件后续数据处理看不懂 一下载数据 RTCGA下载是把所有数据一起下载下来，...
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TCGA数据挖掘一：下载数据并提取临床及表达矩阵信息：RTCGA包 -
RTCGA学习-指定基因在不同癌症的表达量学习代码引自生信技能树https://mp.weixin.qq.com/s/JB_329LCWqo5dY6MLawfEA 1.安装加载RTCGA：R包 2.指定基因HSF1从癌症...
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基于液滴的单细胞转录组测序Drop-seq：从建库到测序的介绍说起单细胞转录组，现在基本已经成为了高分文章的代名词。由于相比于基于整块组织或整片培养细胞总体RNA的bulk RNA-seq，单细胞转录组测序的分辨率提高到了单个细胞的层面...
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单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics要实现单细胞mRNA测序，需要解决2个难题：1. 一个人类细胞中，RNA总量大约只有10pg左右（1pg=10-12g），其中mRNA的量大约只有0.2pg。要把这么少的mR...
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eQTL就那样～（2）前言 我还未想到这个专题叫什么...... 暂定“XXX就那样”？ 6.GTEx数据库是什么？ “人类GWAS-转录组-疾病表型补完计划”，噢不，基因型-组织表达计划（G...
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如何利用R语言进行meta分析—详细教程（以OR值和 95%CI作为效应尺度进行合并）正在阅读本文的小伙伴你好，利用R语言进行meta分析是我比较重要的一次将R语言基础理论应用于实践的过程，并收获了很好的效果。这个应用也是我的毕业论文中研究方法的核心思路...
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R 数据可视化 —— circlize 基因组绘图函数绘图函数 创建基因组数据的绘图区域的函数是 circos.genomicTrack()，或者 circos.genomicTrackPlotRegions()。 其实用方式类...
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circlize R包学习【持续更新中...】颜色通明度设置 列表转化成矩阵 查询当前cell的信息 chordDiagram做圈图 生成的结果图： circos.arrow 画平行于圆圈的箭头 生成的结果图： 做多个环...
