
在R语言中运行Cibersort共需要三个文件,分别是(1)官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”;(2)自己的表达矩阵;(3)Cibersort代码。 (1)LM2...
处理原始scRNA-seq数据 2.1 FastQC 当你获取到单细胞下机数据的时候,第一步需要做的就是检查数据质量。本次教程使用的数据为(Kolodziejczyk et ...
轨迹推断/分析是研究细胞动力学的重要方法,它是单细胞研究应用中一种常见的手段。目前已经开发出了大量的轨迹分析算法,最常用是monocle系列(前面我们介绍的也有),这些算法都...
4.0 安装包 加载所需要的包 清除环境, 读取10x的数据 BC10 文件夹内容 scRNA.counts是一个S4对象。S4对象就像一颗大树一样,有主枝干,有分枝。 创建...
一致性聚类是一种提供定量证据的方法,用以确定数据集中可能的聚类的成员及数量,例如微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用,以发现了新的疾病分子亚类。一致性聚类方...
流程图有更清晰的版本嘛
二代测序(Next generation sequencing)介绍1. 定义 二代测序也被成为高通量测序指的是现代不同的测序技术,不同于之前的Sanger测序,它的速度更快,价格也更为便宜,主要有以下几个平台:-Illumina (Sole...
有很多同学打算写自己的文章,并且打算用Markdown模式来写。我也是这样打算的,但是当我阅读了献给写作者的 Markdown 新手指南后,却在一开始就找不到预览模式,没有预...
博主您好,前面的部分介绍Y形adaptor挺清晰的,但是没有想明白为什么Y形的能保证只有A-reads-B的构型,想请问您可不可以再解释下