小明的数据分析笔记本

最终拿到的数据格式如下 第一列是探针id 第二列是染色体编号 第三类是染色体位置 第四列是第一个样本的基因型 接下来依次是每个样本的基因型 相当于是每行是一个位点，每列是一个...

佳奥

这里是佳奥！我们继续非模式种转录组的下游分析。 上篇我们拿到了raw count矩阵，但是我们还缺少很多东西，让我们一步一步来。 1、选择合适方法标准化表达矩阵 2、GO/K...

EZ

一、统计tns不同染色体上SSR分布 重命名序列名，使用sed命令(1)先修改染色体序列名称 （2）重新查看序列名称 ，因为使用less -SN后一行内容太多不能全部复制 （...

小明的数据分析笔记本

论文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wi...

EwanH

亲缘关系分析实操 前期准备 给标记加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈现，拿到VCF文件的第一件事情就是添加各个SNP位点的ID。先看一下最开始生成的VCF文...

KS科研分享与服务

近期在看一篇Nature genetics关于自闭症的研究文章的时候，看到了这样的可视化图表，是一种点线图。 文章提供了数据，一开始我想到的绘制方法是画出线图，线的上下就是数...

geneonto

启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列，多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被...