TIP--Tracking Tumor Immunophenotype (http://biocc.hrbmu.edu.cn/TIP/) 接下来我们看看TIP可以分析研究点什...
TIP--Tracking Tumor Immunophenotype (http://biocc.hrbmu.edu.cn/TIP/) 接下来我们看看TIP可以分析研究点什...
TIDE(http://tide.dfci.harvard.edu/[http://tide.dfci.harvard.edu/])代表肿瘤免疫功能障碍和排斥,用于评估免疫疗...
参考:1.Package ‘RCircos’[https://cran.r-project.org/web/packages/RCircos/RCircos.pdf]2.Us...
探序基因肿瘤研究院 整理[https://cancer.tanxugene.cn] 1. TCGA-基因表达量等 可以在UCSC的xena网站下载[https://xenab...
这是我听B站鲮鱼不会飞视频(R与Bioconductor的入门课)里的笔记哦~ Bioconductor是什么? Bioconductor是一个专门做生信R包的平台,可以把它...
前言 Immugent在之前的推文:整合多组学数据进行分型之MOVICS[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1Nw==&...
CCLE是肿瘤细胞基因表达的百科全书,之前写CCLE:求任意基因的相关性[https://www.jianshu.com/p/59f979ab09ee]稍微介绍过其用法。今天...
泛癌的基因表达量一般可以用TCGA和GTEx实现,但是肿瘤细胞系一般用CCLE临床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
作者:ahworld链接:单细胞表达矩阵格式转换来源:微信公众号-seqyuan著作权归作者所有,任何形式的转载都请联系作者。 10x Genomics官方软件CellRan...
挖掘公共单细胞数据集时,会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下,方便自己日后调用,以创建Seurat对象(1)barcodes.tsv.gz、features.tsv....
刘小泽写于2020.8.13主要分为两个部分:前面用linux处理,后面用R处理 下载数据 选用的10X测试数据是:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/...
常见错误: 说找不到Barcode文件,但明明存在Barcode: Error in Read10X() : Barcode file missing那很有可能是因为三个10...