请问,"horiz"不是图形参数是为什么?
R语言可视化(二十九):聚类树图绘制29. 聚类树图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用dendrogram函数绘制聚类树图 使用ggdendro包绘制聚类树图 使用ggraph包绘制聚类树图
请问,"horiz"不是图形参数是为什么?
R语言可视化(二十九):聚类树图绘制29. 聚类树图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用dendrogram函数绘制聚类树图 使用ggdendro包绘制聚类树图 使用ggraph包绘制聚类树图
WGCNA的官方文档里有这样一句话:In the past, we called the module membership values kME.
然后,kME的定义是,kMEbrown(i) = cor(xi, MEbrown)
datKME=signedKME(datExpr, datME, outputColumnName="MM.")
而MM:geneModuleMembership = as.data.frame(cor(datExpr, MEs, use = "p"))
我比较过这两个结果,发现是一模一样的,所以它们应该就是一个东西,只不过一个是用WGCNA内置的函数signedKME()算出来的,一个用cor()算的。
WGCNA(6):筛选 hub gene通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...