240 发简信
IP属地:广东
  • 120
    NCBI公共数据库下载10x单细胞数据进行上游分析的全流程

    参考生信技能书一文打通单细胞上游:从软件部署到上游分析[https://mp.weixin.qq.com/s/pQyUieRVXohY1enqjN4lLA]prefetch官...

  • @Hayley笔记 参考了您的代码,"Error in rownames(sc_data) :
    argument "sc_data" is missing, with no default"在这一段也出现了,请问是什么原因呢?
    pred.ScRNA <- SingleR(test = scRNA@assays$RNA@data, ref=ref,labels=ref$label.main,clusters = scRNA@active.ident,fine.tune = TRUE,BPPARAM = MulticoreParam(40))

    单细胞实战2: Seurat+SingleR--从矩阵到细胞类型注释

    单细胞数据标准分析Seurat流程: Seurat官网:https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...

  • @Hayley笔记 我也遇到这样的报错,是在SingleR自动注释预测细胞的
    predictions <- SingleR(test=assay_for_SingleR,
    ref=cg, labels=cg$label.main)
    这步出现的,请问可以如何解决呢?

    单细胞实战2: Seurat+SingleR--从矩阵到细胞类型注释

    单细胞数据标准分析Seurat流程: Seurat官网:https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...

  • 入驻简书第一炮

    你们试过在一个圈子里禁锢了好久后终于跳出来是什么感觉吗? 就如吾名,吾乃一累成狗的医学生,按着卫鸡委的所谓的改革制度参加了考研也即将参加所谓的住院医师规范化培训再加专科培...

  • 给实习医生们的小贴士:如何充实度过实习期

    前段时间跟见习医生们相处了一段时间,有了很多心得体会,于是总结成文,你可以在丁香园的医学教育版块上看到它:http://www.dxy.cn/bbs/topic/301546...