小小的眼睛里，装着……大大的疑惑 全文2800字，伤脑筋…… 今天尝试把自己对于 stranded、reverse-stranded、un-stranded 这个问题的理解给...
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一文阐述链特异性测序——stranded? reverse-stranded? un-stranded? -
《Scikit-Learn与TensorFlow机器学习实用指南》 第07章 集成学习和随机森林（第一部分 机器学习基础）第01章 机器学习概览第02章 一个完整的机器学习项目（上）第02章 一个完整的机器学习项目（下）第03章 分类第04章 训练模型第05章 支持向量...
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TCGA甲基化数据质量控制和差异分析（使用ChAMP包）参考文章：1.甲基化芯片入门学习-ChAMP包（二）2.TCGA数据库的癌症甲基化芯片数据重分析3.TCGA甲基化芯片数据质控和过滤4.甲基化芯片数据的差异分析5.甲基化芯片...
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《全网超全的保姆级 GSEA 代码教程》1 帮师姐做了 GSEA 的相关分析，发现有几点比较容易出错，可以注意一下： 1 GSEA 的 input 是没进行过筛选的 DESeq2 差异表达分析的结果，只是通过 lo...
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《GSEA富集图（Enrichment Plot）解读指南》图片来自https://www.biostars.org/p/367191/[https://www.biostars.org/p/367191/] 第一部分富集曲线： 富集...
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Chip-seq and ATAC-seq数据来源： 1.原始数据下载 2.过滤低质量读段并生成QC 报告 3 Mapping 其中Go_Chip_Seq_PE脚本内容为： 最终生成6 个文件，满足大多数情况下的下游...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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10X单细胞个性化分析之CNV篇最近父亲住院，需要人照顾，需要资金，所以不要脸的求一发大家的支持。 目前单细胞分析而言，分析方向大致包括以下几个方面，1）器官发育（这个用空间转录组更为合适）；2）疾病样本，...
