1 背景介绍 在上一篇文章中，我们介绍了Encoder-Decoder架构，但是这个架构有个问题。就是如果想建模长序列的话，最终encoder编码的最后一个时间步的隐状态很可...
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《Transformer 前传之 Bahdanau attention》 -
《使用Encoder-Decoder架构+LSTM完成机器翻译任务》1 背景 在neural machine translation的任务中，由于RNN每个时间步只能看到过去的信息，无法看到完整的上下文。除此之外，由于source langu...
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韩遇安关于RNN的一些思考1 RNN的架构及原理 关键函数h_t = f(Wxhx_t + Whhh_{t-1} + bh)y_t = g(Why*h_t + by) 2 说人话 我举一个例子，比如R...
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韩遇安关于CNN的一些小思考1 CNN中的一些重要的概念 关于卷积，就是卷积核（kernel）在figure上移动，对应位置相乘然后求和（加权和） 关于池化，分为最大池化和平均池化，是一种下采样（降维）...
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一文阐述链特异性测序——stranded? reverse-stranded? un-stranded?小小的眼睛里，装着……大大的疑惑 全文2800字，伤脑筋…… 今天尝试把自己对于 stranded、reverse-stranded、un-stranded 这个问题的理解给...
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《赵从文浅论stacking model 中如何防止信息泄露》
1. *基模型与逻辑回归 在机器学习中，堆叠模型（Stacking） 是一种常用的集成方法，它将多个基模型（base model）的预测结果作为新特征，输入到一个二层模型（通...
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《全网最全的奶妈级WGBS 全流程教程，不会的来打死作者》写在前面， 本文中使用了 3 个对照组和 3 个实验组，能够满足大多数实验者的需求，除此之外，本文涵盖WGBS 处理的上下游，需要处理WGBS/手头上有 WGBS 数据但是没...
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《全网最全QSEA学习教程！！！》说明，这是搬运的官网教程，我写了注释/我的理解等等，可以说是自己的笔记。 喜欢的留留言，动动小手点点赞呀！😘 参考： https://bioconductor.org/pac...
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测序没有特异性吧？链特异性是建库导致的
技能——如何判断测序数据是否是链特异性
前面的帖子一文阐述链特异性测序——stranded? reverse-stranded? un-stranded?[https://www.jianshu.com/p/670...
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浅谈机器学习中的交叉验证训练（cross validation）和普通的训练
Cross-validation（交叉验证）与普通训练的区别及CV的意义 一、核心区别对比 对比维度普通训练（Hold-out）交叉验证（CV）数据划分方式固定分为训练集和测...
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写的真好
《Scikit-Learn与TensorFlow机器学习实用指南》 第07章 集成学习和随机森林
（第一部分 机器学习基础）第01章 机器学习概览第02章 一个完整的机器学习项目（上）第02章 一个完整的机器学习项目（下）第03章 分类第04章 训练模型第05章 支持向量...
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《Scikit-Learn与TensorFlow机器学习实用指南》 第07章 集成学习和随机森林（第一部分 机器学习基础）第01章 机器学习概览第02章 一个完整的机器学习项目（上）第02章 一个完整的机器学习项目（下）第03章 分类第04章 训练模型第05章 支持向量...
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浅论机器学习中的集成学习1.Introduction: 一些集成学习的策略: Bagging(Bootstrap Aggregating)Bagging 的目标是通过减少模型的方差来提高性能,适用于...
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TCGA Methylation 450K analysis1.introduction to Methylation 450K sequencing: 处理流程： 通过TCGAbiolinks下载甲基化注释，已经病人信息，然后根据4...
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TCGA甲基化数据质量控制和差异分析（使用ChAMP包）参考文章：1.甲基化芯片入门学习-ChAMP包（二）2.TCGA数据库的癌症甲基化芯片数据重分析3.TCGA甲基化芯片数据质控和过滤4.甲基化芯片数据的差异分析5.甲基化芯片...
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《全网超全的保姆级 GSEA 代码教程》1 帮师姐做了 GSEA 的相关分析，发现有几点比较容易出错，可以注意一下： 1 GSEA 的 input 是没进行过筛选的 DESeq2 差异表达分析的结果，只是通过 lo...
