@evaniali 这个需要看到你的结果才能判断
Monocle3:拟时序分析写在前面:今天突然想写这个教程,花了一下午看资料,其实我前面是有一些基础的,但是看的还是会很乱,所以想把这个包的脉络写一下,希望能够可以跟大家讨论一下并且自己以后使用这个包的...
@1804bc936320 这个网上有相关的教程
Monocle3:拟时序分析写在前面:今天突然想写这个教程,花了一下午看资料,其实我前面是有一些基础的,但是看的还是会很乱,所以想把这个包的脉络写一下,希望能够可以跟大家讨论一下并且自己以后使用这个包的...
@鱼啸九天 是的,我一直推崇的是系统的学习生信(像某些10天学完单细胞😱),不要好高骛远,要脚踏实地
芯片数据和RNA-seq的差异分析流程由于太久没有分析过bulk数据了,前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚,所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白,也刚刚了解NG...
由于太久没有分析过bulk数据了,前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚,所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白,也刚刚了解NG...
@evaniali 二者都是被接受的,适合自己文章趋势的就是好的
Monocle3:拟时序分析写在前面:今天突然想写这个教程,花了一下午看资料,其实我前面是有一些基础的,但是看的还是会很乱,所以想把这个包的脉络写一下,希望能够可以跟大家讨论一下并且自己以后使用这个包的...
@decf782bff27 你有安装我说的对应版本吗?pyscenic改版了,需要安装以前的版本才能够直接用那个参考文件
SCENIC-转录因子分析今天写一篇关于单细胞转录因子的分析-scenic在做分析之前你应该看一下这篇文献,看看别人做了什么scenic分析《Single-cell RNA sequencing hi...
我认为是:“老哥,牛逼了”
CIBERSORT:反卷积推测bulk中的细胞类型五一学了一个新的分析方法-CIBERSORT,这个包其实很早就想学的,因为现在一般的单细胞文章的套路,很难不用到它,那么它能干什么呢?它能够推测出bulk RNA每一个样本中...
十分感谢您的分享,让我快速入门了scATAC☺
单细胞笔记11-scATAC-seq上游数据处理一直以来都不是太清楚scATAC-seq中fragments文件、peak calling,以及counts矩阵的关系,本文就来梳理一下scATAC-seq的上游数据处理中的...
@起个详亮的名字 二者之间有什么不同我也不是很懂,假如你只是用表达矩阵得到的loom文件好像不能判断出剪切和未剪切,假如要判断剪切和未剪切的话可以按照RNA velocity的上游分析得到的loom文件就可以得到
SCENIC-转录因子分析今天写一篇关于单细胞转录因子的分析-scenic在做分析之前你应该看一下这篇文献,看看别人做了什么scenic分析《Single-cell RNA sequencing hi...