发简信
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RNA 速率学习笔记最近学习画单细胞的拟时序轨迹图，有一些收获。大家经常使用的一般是monocle，DPT等；RNA velocity是一个比较复杂的方法，它通过细...
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scale_color_tableau颜色我们日常在ggplot绘图时，使用的都是 最近新发现了一个颜色版；可以通过 ggthemes的命令 scale_color_tableau()获...
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单细胞测序类型记录
高通量： 10X（3′ or 5′ scRNA-seq methods ） 特点：只有部分基因体覆盖较低的细胞覆盖深度 低通量： SMART-s...
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词云图wordcloud2：做出好看的词云图展示字符串的利器，画一个漂亮的词云图 最简单的使用 设定特定的形状
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韦恩图UpSetR；比传统韦恩图更加清晰最近刚好用到韦恩图，但是由于term比较多，VennDiagram的可视化效果并不好。然后再一个帖子里看到了UpSetR和Y叔的改进版本upse...
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三阴性乳腺癌（TNBC)
三阴性乳腺癌是乳腺癌的一种亚型，其特征是缺乏雌激素受体（ER：estrogen receptor)、孕激素受体（PR：progesterone ...
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ClusterProfiler用法简介
码住，有时间写
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功能注释富集分析工具总结最近用来做功能注释的方法非常多，走过多个坑之后，对功能注释做一个总结。 我们常用的功能注释也就是GO，KEGG，和Reactom，MSigDB数...