研究生一枚，主要研究方向为植物内生菌及微生物相关内容，公众号【科研后花园】，主要更新内容：1）基于R的科研绘图；2）科研小技巧分享；3）绘图技巧分享；4）科研网站分享。
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QTLseq数据分析，鼠标点点，复现 Nature Plant 番茄论文结果写在前面 快一年了，写了重测序三兄弟插件，几乎所有用户都可以用 TBtools 轻松完成 BSAseq 数据分析。当然，我自己基本也没怎么折腾过，毕竟当时只是为了上个课。前几...
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回顾 | 系统进化树构建的常见方法构建进化树的方法主要分为 距离矩阵法（含 UPGMA、ME、NJ等） 最大简约法（MP） 极大似然法（ML） 贝叶斯法（Bayesian） 基于距离的进化树构建方法 常用的距...
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【现学现卖】review农杆菌介导的真菌转化
Agrobacterium-mediated transformation as a tool for functional genomics in fungi Abstr...
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【现学现卖】实验-PEG介导原生质体转化
The Sclerotinia sclerotiorum pac1 Gene Is Required for SclerotialDevelopment and Virul...
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【R画图学习22.1】进化树和气泡组合图今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中，可以看出，图片分成2个部分，左边是进化树，右边是类似气泡图。 下面我们用一组简单的文件进行测试： 进化树文件： (((A...
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【现学现卖】实验-制备真菌原生质体
更多内容请关注微信公众号-番茄随笔，二维码在简书个人主页 概念 原生质体（protoplast）为细胞壁内的原生质，即指能够和细胞壁分开的那部分细胞物质，包括细胞膜、细胞质...
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F和R指什么呀
表达质粒构建之引物设计
比如我现在需要表达FUS这个蛋白，首先我要确定FUS的CDS区序列，使用NCBI即可获得； 可以看出FUS有三个同源异构体，我们以第一个X1为例来说明； 这是其CDS区序列信...
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【转】CSS 渐变锯齿消失术
在 CSS 中，渐变（Gradient）可谓是最为强大的一个属性之一。 但是，经常有同学在使用渐变的过程中会遇到渐变图形产生的锯齿问题。 何为渐变锯齿？ 那么，什么是渐变图形...
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跟着BioRxiv学作图：R语言ggalluvial包绘制桑基图论文 Environmentally robust cis-regulatory changes underlie rapid climatic adaptation htt...
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学做NAR图表：ggraph做网络图最近在NAR上看到一篇文章： 原文网络图如下： 我们借此机会，通过ggraph作图解析相关参数。详细注释代码和参数已上传QQ群文件！我做的图如下，有一点问题，但不影响我们对这...
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跟着NatureMetabolism学作图：R语言ggplot2转录组差异表达火山图论文 Independent phenotypic plasticity axes define distinct obesity sub-types https://www...
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【R画图学习9.4】南丁格尔玫瑰---柱状图今天我们学习绘制另一种柱状图，又称为南丁格尔玫瑰柱状图，如下图所示。 南丁格尔玫瑰图是弗罗伦斯·南丁格尔所发明的。又名为极区图。是一种圆形的直方图。 南丁格尔自己常昵称这类图...
