1、H3K27ac 组蛋白H3上的第27位赖氨酸残基发生乙酰化，与较高的转录激活有关，因此被定义为活性增强子信号，H3K27ac在TSS（转录起始位点）的近...
IP属地：湖北
-
参考基因组下载和构建STAR索引（人源）0. STAR下载 下载2.6.1b版本的STAR wget https://github.com/alexdobin/STAR/archive/2.6.1b.tar.gz...
-
基于液滴的单细胞转录组测序Drop-seq：从建库到测序的介绍说起单细胞转录组，现在基本已经成为了高分文章的代名词。由于相比于基于整块组织或整片培养细胞总体RNA的bulk RNA-seq，单细胞转录组测序的分辨率提高到了单个细胞的层面...
-
SignalP 5.0：信号肽预测信号肽（signal peptides）：是引导新和成的蛋白质向分泌通路转移的短肽链，长度约5-30个氨基酸；对应的mRNA序列，在起始密码子后，有一段编码疏水性氨基酸序列的...
-
SOPMA--蛋白二级结构预测▲蛋白质性质和结构分析：序列相似的蛋白质具有相似的三维结构不同蛋白质中相同的结构域（domain）具有相似的功能▲分析蛋白质的功能：一级结构：氨基酸的排列顺序；二级结构（se...
-
【shell笔记>命令】linux简单命令速览
ls -F可以轻松区分文件和目录 ls -F -R -R为递归选项，它会列出当前目录 ?表示一个字符 *代表0或多个字符 cp -i会询问是否覆盖已有文件 cp -R可以递归...
-
-
10X空间转录组Visium:基本概念2019年12月3日10X空间转录组Visium流程发布了，不再是Coming soon...。流程打包Space Ranger软件里面，感兴趣的小伙伴可以安装下来学习了，自...
-
单细胞转录组学习笔记-8-聚类算法之PCA与tSNE刘小泽写于19.7.5-第二单元第六讲：聚类算法之PCA与tSNE 笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在：http:...
-
-
R：pheatmap导读 pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类，但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类，具体看分析...
-
转录组中的基因表达模式聚类分析
欢迎关注”生信修炼手册”! 实验设计对于转录组数据的分析是非常重要的，对于常规的case/control实验设计，通过两组间的差异检验就可以得到不同条件下的差异基因；对于多组...
-
Hisat2官网上人类基因组索引的下载
Hisat2是现在很流行的主流比对软件，在现实生活中的mRNA-seq中，有很多时候我们需要将拿到的转录组与参考基因组进行比对 。与大多数比对软件一样，在进行比对前需要先建立...
-
4、RNAseq(4)--Hisat2进行序列比对及Samtools格式转化概况：使用处理后的fastq文件和基因组与转录组比对，确定在转录组或者基因组中的关系。在转录组和基因组的比对采取的方案不同。分别是ungapped alignment to ...
