在以往通用的hmmsearch中，经过一轮hmmsearch（round1）和hmmbuild之后再进行hmmsearch（round2），这样产生的结果round2比rou...
IP属地：内蒙古
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hmmsearch寻找目标序列以及去除假阳性步骤
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我也是这样
【生信】HMMER：hmmbuild自建hmm文件
参考：https://www.omicsclass.com/question/705 首次用hmmsearch对我的蛋白质进行结构域搜索，最终只得到30个结构域。 拿这30个...
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写的特别清楚
广义线性模型一（Generalized Linear Models，GLM）
参考从线性模型到广义线性模型（1）——模型假设篇 | 统计之都 (cosx.org)[https://cosx.org/2011/01/how-does-glm-genera...
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广义线性模型一（Generalized Linear Models，GLM）参考从线性模型到广义线性模型（1）——模型假设篇 | 统计之都 (cosx.org)[https://cosx.org/2011/01/how-does-glm-genera...
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谢谢代码，很好用
选择blast比对第一条best hit的结果
blast的结果中每条contig都会有很多hit，最好不用max_target_hit这个参数，因为它输出的是数据库中top的序列而不一定是比对最好的序列，即使所有版本都包...
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没有，配置好的话不应该，你看看是不是没写对路径或者环境变量什么的
SRA Toolkit安装以及配置流程
先反思之前的问题： 之前下载了SRA数据后，进行分割，运行如下命令 /home/whu/program_and_files/sratookit.2.10.0/bin/fast...
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Jalview使用方法（1）——多序列比对今天我们介绍一款全平台可以使用的多序列比对工具，那就是Jalview，它的功能非常强大，但是我们今天讲解最基本的多序列比对及结果输出。 1. 导入序列 你可以导入你的fast...
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图呢？哈哈
群体遗传学统计指标——种群核苷酸多样性
理论 种群核苷酸多样性，顾名思义指的就是核苷酸多样性，值越大说明核苷酸多样性越高。通常用于衡量群体内的核苷酸多样性，也可以用来推演进化关系。计算公式为： 计算群体的π值，可以...
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不好意思，没细看你的代码，做出了错误判断，望谅解
「简化基因组」如何过滤用GATK分析得到的SNP
GATK官方提供了一个SNP过滤的标准，howto-apply-hard-filters-to-a-call-set,如果你按照它的要求来过滤简化基因组中的SNP数据，也就是...
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为什么 BAM 文件 sort 之后体积会变小
测序数据比对结果 BAM 文件用 samtools 进行 sort 之后发现体积变小了...当时怀疑是不是 sort 过程中有一部分 reads 被丢弃了？于是统计了一下原始...
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SRA Toolkit安装以及配置流程先反思之前的问题： 之前下载了SRA数据后，进行分割，运行如下命令 /home/whu/program_and_files/sratookit.2.10.0/bin/fast...