双序列局部比对的算法和全局比对算法的步骤相似,只是赋值规则稍有不同,每个单元格的分值由前面对角线的分值和引入一个空位得到的分值的最大值决定,但是分值不能为负值,如果为负值,则...
关于infercnv的输入文件整理和运行参数参考01.infercnv-区分肿瘤样本中的正常上皮细胞-infercnv运行[https://www.jianshu.com/p...
作图时,可通过以下资料找到自己想要的图片格式 可视化网址: http://www.sthda.com/english/[http://www.sthda.com/englis...
paste函数和paste0()函数,连接字符 substr/substring 提取或替换字符串向量中的字符substr(x, start, stop)substring(...
tail(dataframe) # 查看数据框的倒数6行数据 head(dataframe) #查看数据框前6行数据 sort()##将向量或因子(部分)排序(或排序)为升序...
你好 ,我分别用design <- model.matrix(~0+Group)和design <- model.matrix(~Group)将基因分成了两组进行了差异分析,后续均没有用比较矩阵,最后将topTable(fit2,adjust='BH')提出来的结果比较了一下,发现二者结果不一样。也就是说即使分组只有两组,只要design <- model.matrix(~0+Group),后面就必须要用到比较矩阵。对么 ?
那些常用的limma操作刘小泽写于19.12.29 + 2020.1.1这一篇不扯别的,只列我认为比较重点的limma包的知识,所以代码部分可能比较多。但也会用不同的知识点来区分 前言 limma的...
###grep() grep(pattern, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, value = FALSE, fixed =...
###apply函数 返回通过将函数应用于数组或矩阵的行或列而获得的向量或数组或值列表。 apply(X, MARGIN, FUN, ...) X:包含矩阵的数组; MARG...
###unique(x),删除向量中重复的元素或数据框中重复的行