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有重复样本RNA-seq count数据分析写在前面： 分析之前需要两个文件文件1：countMatrix.txt数据，其中存储着实验组与对照组的基因表达的count值（行是基因，列是样本名）同时注意如果数据里面有缺失...
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R语言处理CCK8或MTT数据，一步绘制生长曲线CCK8数据主要是统计OD450的吸收值，一般的数据形式如下，保存为csv格式 加个P值，调整坐标，适当美化 首先预统计看下结果 结果还不错，添加显著标志 细节地方AI处理一...
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maftools画瀑布图（oncoplot）什么是瀑布图 这种由麦肯锡顾问公司所独创的图表类型，因为形似瀑布流水而被称之为瀑布图( Waterfall Plot)。瀑布图具有自上而下的流畅效果，也可以称为阶梯图（Cas...
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第7篇：用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化上一步骤（第6篇：重复样本的处理——IDR）用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估，同时得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr，接下来就是对p...
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CRISPR-Cas9基因编辑技术简介CRISPR-Cas9是继ZFN、TALENs等基因编辑技术推出后的第三代基因编辑技术，短短几年内,CRISPR-Cas9技术风靡全球, 成为现有基因编辑和基因修饰里面效率最...
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常见实验室小鼠的命名规则~
中科联盟，随时随地预约仪器。 根据遗传特点的不同，实验小鼠可分为三大类： 近交系、封闭群和杂交群 。 参考标准：中国国家质量监督检验检疫总局发布的〖实验动物 哺乳类实验动物的...
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本号停更
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你好，你这样两两之间不是事后比较，仍是默认的Wilcoxon检验
R使用笔记：ggplot2 & ggpubr 给boxplot添加significance levels
本次笔记内容：用ggpubr的stat_compare_means()给boxplot加上significant labels编写函数选择P值小于某一值的pairs，并只在图...
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R 数据可视化 —— 聚类热图 ComplexHeatmap(一)前言 使用 pheatmap 已经能够绘制满足大多数要求的聚类热图了。 受 pheatmap 包的启发，ComplexHeatmap 提供了对热图更多更灵活的控制，如多数据热...
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R 数据可视化 —— circlize 复杂图形与图例复杂图像 我们可以使用一些简单的图形对象，将它们组合起来，绘制成各种复杂的图形 1. 圆形柱状图 我们介绍过了各种柱状图/条形图的绘制，如堆积型、并列型，还有径向柱状图，现在...
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使用oncoPrint绘制瀑布图杀杀生信分析中，我们在全基因组测序后会获得分子突变谱信息，如何直观地将各种疾病分子亚型下的基因突变特征，以及分子共突变/互斥突变的特征展示出来呢？ 我们可以使用R语言中一个非...
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maftools包计算TMB值肿瘤突变负荷(TMB)计算 原文出处：https://mp.weixin.qq.com/s/xuwiZWl8hTVzU2m39dIfxg[https://mp.weixin....
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R数据可视化1: 火山图拖延症让我一直疲于整理qiime2的分析过程。而且手上暂时也没有相应的16S数据要分析，所以打算整理整理R的画图脚本。而且总是百度一些画图细节让我“厌倦”了，觉得自己急需整理...
