植物基因组里藏着大量调控元件和结构信息,它们分布在编码区和非编码区,参与转录起始、可变剪接、染色质开放等关键过程。这些区域碱基组成不均、依赖关系长、交互复杂,传统窗口式模型很...
植物基因组里藏着大量调控元件和结构信息,它们分布在编码区和非编码区,参与转录起始、可变剪接、染色质开放等关键过程。这些区域碱基组成不均、依赖关系长、交互复杂,传统窗口式模型很...
2026年4月23日,英国生物银行(UK Biobank,以下简称UKB)首席执行官Rory Collins发现了一个令人震惊的事实:提供给三家中国研究机构人员使用的约50万...
近期,山东农业大学刘红军联合内布拉斯加大学杨金良等团队在Nature Communicaitons 上发表研究论文:The incomplete dominance of g...
番茄是重要蔬菜与果实研究模式植物,经万年人工驯化形成现代品种。人工选择提升产量等性状,但造成遗传瓶颈、多样性降低与有害突变积累。当前育种转向风味与营养,亟需以基因组解析为基础...
提高大豆籽粒蛋白含量是大豆遗传育种的核心目标之一。传统育种依赖多年多点田间表型筛选,周期长且成本较高。东北农业大学宁海龙教授团队近期在The Crop Journal发表研究...
提高大豆籽粒蛋白含量是大豆遗传育种的核心目标之一。传统育种依赖多年多点田间表型筛选,周期长且成本较高。东北农业大学宁海龙教授团队近期在The Crop Journal发表研究...
全基因组重测序技术凭借覆盖全面、检测精准的特点,已成为挖掘功能位点、解析性状遗传基础的重要工具。随着研究群体规模的持续扩大,面对畜禽、水产以及水稻、小麦、玉米、大豆等作物的大...
最近和朋友聊到一个问题:为什么现在的大语言模型在解读基因组数据时,效果总差那么一点意思? 不是模型能力不够,也不是训练数据不足,问题可能出在数据格式本身。 比如我们用了十几年...
2025年10月,国际水稻研究所(IRRI)公开发布了其水稻育种现代化的核心成果——Onerice育种框架,其宣称该框架已在IRRI及其合作伙伴的育种网络中全面落地。那么,今...
基因挖掘与性状定位是连接表型变异与底层核酸序列差异的关键桥梁。长沙米源生物科技有限公司依托高密度变异图谱与多组学生信算力,构建涵盖全基因组关联分析、高密度遗传图谱构建及极端混...
最近在一对一辅导一位同学做全基因组关联分析(GWAS)项目。他在处理一批水稻的数据时,使用 rMVP 跑流程遇到了几个非常典型的坑。从上千万个原始变异位点的质控过滤,到代码报...
近日,华中农业大学胡学海&上海交通大学陆钰明团队在Plant Communications 发表了题为TargetGAN: A generative AI framework...
陆地植物约有45万个物种,构成了陆地生态系统的根基,也支撑着人类文明。从不足0.1Gb到超过160Gb的基因组大小,从以单倍体配子体为主到以二倍体孢子体为主的生活史,从根、叶...
分享近期一篇发表在 Communications Biology 上比较接地气的文章:Large scale wheat data integration improves ...
全基因组重测序(Whole Genome Resequencing, WGRS)是对已知参考基因组序列的物种进行个体或群体测序,通过与参考图谱比对,全景式鉴定单核苷酸多态性(...
近期,张志武&王嘉博老师在Molecular Biology and Evolution上发表GAPIT Version 4。 GAPIT 第4版的核心是将全基因组关联分析(...
中国是全球首个成功实现杂交水稻商业化应用的国家。自1964年袁隆平院士团队开启水稻雄性不育研究,到1970年发现野败型不育系,再到1973年三系杂交体系正式建立,这项技术在半...
今日分享一个我们团队创始人数年前在Plant Physiology发表的一项研究:Genetic basis of heterosis in rice: insights f...