这篇文章的目的是为了帮助理解Seurat在单细胞转录组分析中可以做哪些事,并且对整体的数据分析流程有一个整体的认识。并不包含代码。转载请注明出处 1.单细胞测序分析的整体流程...
写在前面 近期辅助课题组成员做一些上游数据分析,于是跑了前面搭建的流程并准备了系列分析结果文件,大体如下: 在其中「差异表达分析」的文件夹中,有系列文件,包括 KEGG Pa...
当我们拿到基因表达数据之后,主要使用过表达分析(ORA)和基因集富集分析(GSEA)来探索基因的功能,有的时候还需要挑感兴趣的通路画图(热图、GSEA图之类的),借用Y叔Cl...
一行代码绘制火山图的R包诞生了!在过去的一年中,师兄先后生信绘图系列和高分SCI复现系列中更新了多种不同的火山图的绘制方法,包括普通的火山图、渐变火山图、以及包含GO通路信息...
有了R语言的基础,以及ggplot2绘图基础,我们的生信常用分析图形的绘制就可以提上日程了!本系列,师兄就开始带着大家一起学习如何用R语言绘制我们自己的各种分析图吧! 由于本...
你好,请问这个热图中间的连线代表着什么🤔
跟着高分SCI学作图 -- 复杂热图+渐变色连线从这个系列开始,师兄就带着大家从各大顶级期刊中的Figuer入手,从仿照别人的作图风格到最后实现自己游刃有余的套用在自己的分析数据上!这一系列绝对是高质量!还不赶紧点赞+在看...
通过 KEGG 富集分析得到通路图非常模糊,无法直接用于文章发表。而我们在一些大佬的文章里看到的通路图却非常漂亮,如下,很明显,这样个性化的通路图是作者花心思重新绘制的。 那...
只有基因组,想画一个代谢图,折腾了好几天,最后发现仔细看官网文档是最快的,网页搜到的很少有详细讲解的,大多都是只讲一个部分,所以老老实实看官网是最快的。当然若是能检索到中文的...
Identification of Potential Key Genes for Pathogenesis and Prognosis in Prostate Cancer...
今天是不用学代码利用生信软件联合“点点点”就可以取得hub基因的“白痴”实操,赶快点起来~ Hub基因(关键基因)是在生物学过程中发挥重要作用的基因,它往往在通路中为主导地位...
在上一篇帖子上完成了表达量数据和表型数据的整理,这篇文章将进行网络构建和模块检测。 WGCNA(1):R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.com)[https...