BLAST的主要理念 blast是区段比对，对于给定的两个序列，blast会把具有相似性的片段（hit）找出来，显示的是hit的信息。 Search may take pla...
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blast主要方法使用总结（Linux） -
HISAT2 Bowtie2 提取唯一比对 unique mapping reads
把read比对到基因组之后，需要提取唯一比对来进行下一步分析。 bowtie2和HISAT2 都没有只输出唯一比对的命令，所以需要对比对结果sam文件进行提取，可以通过sam...
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👢[linux]awk按照某列分组求另一列均值
我这里先抛出问题，我手上有套数据：包含三列，第一列ensgid、第二列symbol，第三列fpkm值。数据问了老师，老师说相同的ensg对应的fpkm值，求均值。所以针对上方...
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R语言传参2022-08-24
R语言传参快速使用脚本 简便版 进阶版 getopt方法 optparse方法1 optparse方法2 R使用getopt包传参 补充：系统自带的传参方法commandAr...
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bam2fastq(bam文件转fq/fastq)
bedtools工具包bamtofastq转换工具 picard中的SamToFastq转换工具 samtools亦可进行bam文件（到fq）的转换 总结一下 此三种方法，某...
