pheatmap,全称Pretty Heatmaps,直译“完美的热图”,是一款非常优秀的热图绘制R包。网上也有很多可供参考的教程[1][2],在初学R后,我也曾写过了一篇教...
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pheatmap参数: 网上有针对热图绘制的粗略讲解,但是都是参数不完整,可能不能满足所有人需求,于是手动整理了热图的全参数介绍。 mat 数组矩阵(要绘制热图的数据源,保证...
火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多,Excel和第三方软件等,本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...
数据筛选是在分析中最常用的步骤,如数据挖掘分析中,从TCGA或GEO得到的表达矩阵要不断筛选,来进行数据整理。match函数是生信技能树生信爆款入门课程[https://mp...
差异基因筛选的常见方法有edgeR, DEseq2, EBseq等,这篇文章主要介绍DEseq2。 官方网站:https://bioconductor.org/package...
1.首先进入TCGA官网 TCGA官网网址:GDC (cancer.gov)[https://portal.gdc.cancer.gov/] 2.注意所圈出的Cart,如果C...