jjjscuedu

比较基因组学中，共线性的分析的图无疑是很漂亮的。 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。上一篇介绍了怎么利用MCScanX来做共线性分析，虽然后面有java的包来支持...

Bioinfor生信云

基因家族树构建最常用的方法是 NJ 法和 ML 方法，构建进化树之前，需要进行多序列比对。 多序列比对 多序列比对的作用是将核酸或者氨基酸序列对齐，使得相同残基的位点位于同一...

xuzhougeng

一般基因组文章都会有下面这种酷炫图，用来描述基因组的基因密度分布，转座子的密度分布，和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系，以及其他各种你只要测序就能加上的信息，比如...

生信师姐

转载自 LAI: 评估基因组质量一个标准 基因组组装完成之后，就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的contig文件中，每个contig都能足够的长，能够有一个完整的基...

深山夕照深秋雨OvO

0.参考https://github.com/zhaotao1987/SynNet-Pipeline[https://github.com/zhaotao1987/SynNe...

周小钊

前言 最近的推文将是一个大系列，目录就不放了，可能会有点多，主要涉及了基因注释，比较基因组学分析，基因家族分析等，大家看我博客的顺序就行。 基因注释参考链接[https://...

wo_monic

目前热门的单体型基因组组装，以下内容来源于安诺的单体型基因组组装新品发布会单体型也称为单倍型。二倍体有两套染色体单体，一套来自父本，一套来自母本。在父本和母本之间会存在一些差...

非编码

Rfam是用来鉴定非编码RNA的数据库，常用于注释新的核酸序列或基因组序列。 最新版本的Rfam14.4，已经包含了3941个家族。 Rfam官方网址：https://rfa...

生物信息与育种

1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA，它...