《我在北京送快递》胡安焉之前看了《在工作中看到中国》，以为这本可能是跟风出了本书。连续几周在豆瓣排行榜上，前天拿来看看。我以为作者是农村出身，去送快递，竟不想父母是事业单位。...
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bedtools的使用--------------- ################# Nickier 2018-12-14 ################# --------------- ...
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《亲密关系》读书笔记第一章 人际关系的构成 1.亲密关系的性质和重要性 2.文化影响 亲密关系变化的根源（个人觉得这段有趣） 经济发展：影响因素涉及经济发展。社会工业化程度越高、越富足，越能接纳...
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SARS-CoV-2刺突蛋白抗体疫苗应答与癌症患者感染严重程度的相关性——全国COVID癌症横断面评估1.研究背景： 尽管新冠肺炎疫苗接种率高，但SARS-CoV-2大流行依然是一个医疗问题。与普通人群中SARS-CoV-2的免疫和保护水平有所不同，一些群体面临着极端风险。免...
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@心惊梦醒 好嘞，谢谢大佬~感谢~
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运行以下核心代码有警告信息： Use of uninitialized value $_ in pattern match (m//) at test.pl li...
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这个问题不影响结果是么？
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ctDNA指导帕尼单抗在转移性结直肠癌中的再用药： 2期CHRONOS临床试验1.研究背景抗表皮生长因子受体（EGFR）单克隆抗体已被批准用于RAS野生型（WT）转移性结直肠癌（mCRC）的治疗，但最初受益于EGFR阻断的患者几乎总是会产生耐药性。从分...
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Q: Should I always do smoothing, even for RRBS data?
A: Smoothing is always recommended, even for RRBS. In RRBS, CpG sites are likely to be clustered locally within small genomic regions, so smoothing will still help to improve the methylation estimation.
https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DSS/inst/doc/DSS.html#4_Frequently_Asked_Questions使用DSS进行BS-seq差异甲基化分析
总览 为了检测差异甲基化，在每个CpG位点进行统计测试，然后根据指定的阈值进行差异甲基化位点（DML）或差异甲基化区域（DMR）分析。 严格的统计测试应考虑重复样本之间的生物...
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https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/CoxBoost/
CoxBoost
单纯的COX模型可解释性很强，但是预测性能不能满足我的要求，所以采用花式优化COX模型。想了两种方法，一种是用Boosting，Bagging，方法二是提取主成分。然后今天搜...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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您好GSE80316数据集中的ID_REF是“2839538_st”这种，但是GPL17586中的probeset_id，和ID是TC01000001.hg.1完全不对应
GPL17586、GPL19251和GPL16686平台芯片ID转换
原文载于生信技能树我写此文是为了致敬生信技能树团队！感谢他们无私分享！ 以下是生信技能树学员笔记投稿 芯片分析中经常会遇到Affymetrix Human Transcrip...
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@Refrain_9738 是不是你的变量都有相关性啊
TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）
测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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不需要分组信息么
用clusterProfiler做GSEA（二）
之前写过用clusterProfiler做GSEA,enrichplot中的gseaplot作图，但是图没有最新版enrichplot包的gseaplot2做的图好看。此外，...
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NCBI数据库Fastq原始序列上传和登录号获取最近文章要求原始数据上传NCBI数据库，小白摸索了一路总算有了点认识哈哈~写下来当做笔记。 1.账号 首先我们要登录NCBI网站，见图1右上角，如果有账号直接登陆就好。没有的...
