这阵子开始做比较基因组的项目，由于没有root而且也不想折腾orthomcl，所以首选orthofinder，故而先是安装，这次使用conda安装 安装完成之后，本来打算用r...
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【orthofinder】在被限制进程的服务器中使用注意事项 -
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树，最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大，在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的，然后跟老师...
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用R语言进行相关性分析：画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值一. 读取数据 因为我们一般自己录的数据都是excel表格的，对于读取excel，此处有一个小技巧 读取excel方法 1.把excel文件另存为CSV文件 2.按照读取cs...
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鉴定tandem repeats的python脚本
链接https://github.com/rohansachdeva/tandem_repeats[https://github.com/rohansachdeva/tand...
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Linux中的文件内查找小技巧写在前面的废话 这一周我为自己的马虎付出了严重的代价！！！每天十几个小时一直在debug……以后写代码之前一定要拜拜雍正，专治八阿哥（bug） 虽然debug让我无心其他事情...
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正则表达式神器，以后再也不用百度了当有项目需求用到正则表达式，你会怎么做？打开百度直接搜索「手机号正则表达式」，复制到 IDE 运行一下看一看符不符合自己的期望？ 是不是常常因为找不到合适的表达式，深恶痛绝。...
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使用R语言对SSR数据做主成分分析（PCA）的一个简单小例子昨天的推文介绍了使用R语言对比对后的DNA序列做主成分分析的一个简单小例子，推文下有朋友留言问如何对0,1矩阵做主成分分析（PCA）查了一下参考资料找到了一个办法 参考资料的...
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群体结构——Structure堆叠图详细画法基本概念 基迪奥有篇文章写得非常的简单明了，我这里就不再赘述，大家移步去搞清楚基本知识。 群体结构图形——structure堆叠图[https://www.genedenov...
