Multi-omics network characterizationreveals novel microRNA biomarkers and mechanisms fo...
IP属地：广西壮族自治区
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基于多组学网络的生物信息学方法识别 KTR中miRNA 生物标志物（IF8+） -
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R代码合并新版TCGA数据库RNAseq表达谱数据小编发现我们经常使用的TCGA数据库，大概在2022年4月初进行了更新。以前RNAseq数据使用的是Htseq-counts，新版本中使用了STAR-counts。在上一期中...
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TCGA数据库悄咪咪更新了—RNAseq没有HTSeq-Counts了前面小编给大家详细介绍过TCGA这个数据库，以及如何从这个数据库下载，合并表达谱数据。然后做差异表达分析，以及构建ceRNA网络。 ☞[https://link.zhihu....
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m6A甲基化前沿 表观遗传学，包括组蛋白共价修饰(covalent histone modification)、DNA甲基化修饰(DNA methylation)、RNA甲基化修饰(RN...
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IOBR:一个R包带你走进数据挖掘的殿堂
鉴于前一段时间有小伙伴私聊 Immugent 说生信宝库是不是专门只写单细胞相关的推文呀，其实，这只是凑巧最近发的都是单细胞相关的。虽然近几年产生了大量的单细胞数据，但bul...
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CIBERSORT 免疫浸润(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT的介绍 Importantly...
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Python单细胞测序分析教程 - 2| 下载测序数据并处理为scanpy可读取的格式本教程介绍了在GEO数据库中下载单细胞数据集的方法，并进一步处理为scanpy可读取的格式。 第一步：GEO数据库下载单细胞数据 NCBI：https://www.ncbi....
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如何使用R语言找出某一个通路的所有基因名字
上周为了督促自己有效的学习，立下了每周至少更一篇生信学习笔记的flag。 本打算从这周开始先写一系列的生信基础概念知识，没想到很快就接到了大佬Jimmy老师的一个小任务：如何...
