上期内容回顾： 上海唯那生物：微生物基因组研究扫盲系列zhuanlan.zhihu.com[https://zhuanlan.zhihu.com/p/347848359]上海...
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有2株大肠杆菌（细菌），如何通过测序的方法知道二者的差异？
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如何构建fasta文件及其index索引文件
需要准备的文件是序列信息bed格式文件或者GRanges格式文件 比如有一个bed文件： 我习惯保存为GR格式： toGR是我自己编写的函数，这里就不放出来了。此外还编写了另...
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群体结构——系统发育树的构建最近杂事真的非常的满，终于找到时间更新一下。。。。 通过上一篇文章的介绍，系统发育树的基本概念[https://www.jianshu.com/p/4c5a4bf84e57]...
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WGS-variant calling pipeline (变异的探索流程)
GATK升级4.0版了，作为一个call variant的非常常用的软件，之前我一直是在使用3.8的版本，这次也正好整理下，将GATK基本分析流程过渡到4.0版本，看看具体有...
