写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是,常用的快速构建ML树的软件是FastTree,如果要求准确,我会在服务器上使用RaxM...
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写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是,常用的快速构建ML树的软件是FastTree,如果要求准确,我会在服务器上使用RaxM...
DNA测序之mapping介绍 准确度。 基因组很大,并且有重复,如何准确的mapping到基因组。如果比对错误,则会造成假阳性的variant。 敏感性。 有variati...
1. 原始数据的解释及相关概念 原始数据的概念: A.测序仪完成测序后生产的测序文件,经过单样品拆分后,获得的单样品测序文件。 B.或者 测序仪测序完成后,由测序仪直接拆分的...
导读 gggenes: Draw Gene Arrow Maps in 'ggplot2'。 Github:gggens[https://github.com/wilkox/...
目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便使用者发现共线性(collin...
TBtools 是一个集合了超多生信处理的小工具,非常方便,而且是无命令行的操作,入门门槛极低。开发者是华南农业大学陈程杰博士,TBtools文章地址:https://www...
最近在对于一些关于基因组的数据进行处理,发现如果在NCBI上下载一个物种例如E. coil的基因组序列之后,有很多并不常见的文件类型,例如.asn.faa.ffn.fna *...
导读 开始有关病毒的基因组学研究。 分析工具特点发表杂志发表时间被引(2021)VirSorter组装,PERLPeerJ2015585VirSorter2组装Microbi...
首先查看自己的linux内核版本: 可以看的自己的版本信息,我的是 free命令查看内存使用情况: 补充:关于cache和buffer的区别buffer表示有多少RAM专用于...
linux下解压命令大全 .tar 解包:tar xvf FileName.tar打包:tar cvf FileName.tar DirName(注:tar是打包,不是压缩!...
1、搜索基因组 在这个网址(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/browse/#!/overview/)里搜索,如:Streptomyce...
NCBI(National Center for Biotechnology Information)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/[https:...
细菌域 1.候选门级辐射类群Candidate Phyla Radiation 01. 维尔特菌门Wirthbacteria 02. 多伊卡菌门Dojkabacteria 0...