生信学习者2

前言 对质谱数据做单变量的组间差异检验后，我们获得了检验的结果。常用展示结果的方法有图和表的方式，我们在文献中常用图来展示，而表可作为附表补充图。 本文讲使用火山图，韦恩图和...

iColors

R在RNAseq和基因组关注的比较多，在蛋白质组研究中虽然用的多，但是专门的博客和文章比较少，转载一个蛋白质组学数据分析的文章。原文见https://datasciencep...

Clariom

之前在Connectivity Map(cMap)的探索应用（二）中提到了两种cmap在线分析网站，一个是build2 ；另一个是CLUE平台。bulid2在cMAP在线分析...

生信start_site

WGCNA分析过程中，你可以得到edge和node的文件，里面有你某一个module里所有基因相互之间的connectivity的weight值，根据这些值你可以将它们之间的...

Hayley笔记

基因表达趋势分析-1：TCseq[https://www.jianshu.com/p/b808085c7351] Mfuzz能够识别表达谱的潜在时间序列模式，并将相似模式的基...

pingu的生信备忘录

Mfuzz 工具采用模糊 c 均值聚类（Fuzzy C-Means Clustering，FCM）算法，根据具有时间序列特征的转录组、蛋白质组数据中基因或蛋白表达的时间趋势，...

小鱼爸

RNA-Seq 分析流程：多时间点样本分析实战（一） 小鱼爸 2023-07-12 简介 了解基因表达的时序动态变化是生物学的一个基本问题。此教程提供了多时间点数据的分步实战...

Biofantasy

  在跟着健明老师学习生物信息学的过程中，少走了很多弯路，躲过了很多坑，在指导下浅尝过一些。但是自己常常扣原理，又双叒叕落坑，百思不得其解。以下是之前遇到的问题，今天整理带大...