发简信
IP属地：上海
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人生百态，技术分享
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sam的格式和duplication的4种原因picard解释flag的官网链接：https://broadinstitute.github.io/picard/explain-flags.html [DNA-Seq] ...
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会做实验的生物信息小蚊纸~~~
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HZAU植科院农学本科毕业生<br>HZAU信息学院生信专业硕士毕业生<br>目前就职于国内某知名药企数据分析岗位<br>主要擅长SAS,R,Python,Linux,Shell,Power BI,Power automatic<br>对爬虫、网站搭建感兴趣<br><br>欢迎一起讨论呀~<br>简书不定时查看，有需要欢迎知乎私信:<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fcao-kai-30-84" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/cao-kai-30-84</a>
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头像女朋友╰(￣▽￣)╭<br>文章以后只会在公众号更新：<br>哈队长的杂室
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2020-08-25 R学习资源
转载自https://github.com/iamericfletcher/r-learning-resources/blob/main/code_of_conduct.md...
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珠江医院肿瘤科简书号，同时也欢迎大家关注我们的微信号！
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TB店铺同名
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基因突变检测之Mutect2写在前面的话 今天是2021年1月3号，年底一番瞎忙活，停更了好长一段时间的简书。人生中有个很重要伯乐导师告诉我，在这个事多的工作环境下，没人愿意看你太多的废话。直奔重点才是...
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GATK4插件Mutect2参数解析作者按 最近在准备着换一个职业赛道，所以在做之前所有项目的回溯，遇到了最最基础的SNV+Indel的流程，给别人重新讲了一遍Mutect2的过滤规则和参数选择，发现这个，含金...
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GATK入门的最佳姿势
GATK，全称是Genome Anlysis Toolkit，顾名思义，是一套用于分析基因组的工具箱。主要功能是寻找变异位点和基因分型，但是实际上功能超多，导致初学者都不知道...
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没有什么不是认真搞不定的！！！
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请问这个bed文件是运行过程中生成的还是自己从网站下载提供给程序的？如果是mouse的话是否可以直接到ucsc下载？不太理解这个bed的意义，求指教。
GATK Best Practices — step1 数据预处理（Data Pre-processing）
一、数据预处理（Data Pre-processing）介绍 这一步主要是对BWA得到的bam进行一系列处理（包括sort/dup的标记/碱基质量值矫正），最终得到GATK ...
