总结：第1、6、7距离算法较多，但是1计算距离前无法对原始OTU进行hellinger转换，相反6和7均可以，但是7操作步骤稍显复杂，使用6更快捷方便ps：怎么做hellin...
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R 常用微生物距离函数记录
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不断学习，不断忘记，不断回顾，不断进步，这便是凡人的学习方式,或谓曰：Attention is all you need,but learning is all your attention.
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[R] 如何快速生成许多差异明显的颜色？这个需求真的太常见了！注意问题强调的几个关键词：一是快速，二是大量，三是差异明显。在生成大量元素比较图时要明显区分不同样本，比如宏基因组中的物种分析： 方法一：自定义 自定义...
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@Silver_42ac conda 会自动匹配适合的版本
GATK4 conda 安装
conda 直接gatk并不完整，总会有问题，这里提供摸索后的conda安装解决方法 gatkcondaenv2 文件内容
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根据gatkcondaenv.yml 中的版本填写就行了，我这里主要是 intel-openmp 版本与其它依赖冲突
安装汇总遇到的版本不兼容，就把指定的版本号，如“intel-openmp=1.2” 改为 intel-openmpGATK4 conda 安装
conda 直接gatk并不完整，总会有问题，这里提供摸索后的conda安装解决方法 gatkcondaenv2 文件内容
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不再更新
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个人主页：hbox.cool
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MetaPhlAn4 Meta taxonGithub: https://github.com/biobakery/MetaPhlAn/wiki/MetaPhlAn-4[https://github.com/biob...
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生信博士生一枚，分享科研代码，经验。推文一般很长，努力将一个问题讲全面，感谢你的耐心阅读。
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diamond提速
安装使用 比对nr库 提速办法 亲测增加 --block-size 15 --index-chunks 1这两个参数后速度提升10倍以上。 参考：使用DIAMOND将全基因组...
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连雨不知春去，一晴方觉夏深
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南京大学生物学，佛系更新~
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在写了（行数1，字数0）。
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心有明月，诸事无悔。愿执萤火，仰望星空。已转生活号。
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【软件安装】interproscan-5.59-91.0
【1】conda 安装 存在问题 share/InterProScan/bin/prosite/pfsearchV3 依赖GLIBC_2.27 GLIBC_2.27 not ...
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