好记性不如烂笔头，温故而知新。踏实一些，不要着急，你想要的岁月都会给你！
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从gtf文件提取lncRNA
先查看gtf注释文件中的gene_biotype个数 用R提取 R包： refGenome下载地址： https://cran.r-project.org/src/contr...
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R语言 Bioconductor包的安装指南
R语言 Bioconductor包的安装指南 (2012-09-15 19:11:55) http://r-china.org/forum.php?mod=viewthrea...
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R Package Scissor 学习笔记简介Scissor R包提出的Scissor算法(function Scissor)，这是一种新颖的单细胞数据分析方法。利用批量（bulk）表型从单细胞测序(scRNA-se...
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搬砖的工人<br>
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生物信息从业者，关注AI制药、癌症、微生物领域
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生信阿拉丁，为实用而生
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ATAC-seq数据可视化——超简单教程
大家好这里是有时候季更，有时候月更的基因组学研究生。上一期记录了ATAC数据从Fastq数据到bam文件的处理脚本。 ATAC数据一键处理基因组学研究生，公众号：基因组学研究...
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随笔记录，方便查找；<br>欢迎扫码交流
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ATAC-seq背景知识 真核生物的DNA并不是裸露的，而是会与组蛋白结合。DNA缠绕在组蛋白上，形成串珠式结构，珠是组蛋白，线是DNA。这样的结构进一步折叠，并在其它蛋白的辅助下形成染色质...
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ATAC-Seq 数据分析（上）背景： 染色质和染色体的结构和功能 每一条染色单体由单个线性DNA分子组成。细胞核中的DNA是经过高度有序的包装，否则就是一团乱麻，不利于DNA复制和表达调控。这种有序的状态...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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Linux篇：shell中while read line的用法及实战
01 前言 在shell脚本中，我们经常看到以下的一种结构： while read linedo…done < file 可能不熟悉shell的人看到这个会有点懵，其实这是s...
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ATAC-seq生信分析综述翻译(Genome Biology)这是目前为止我看到过的关于ATAC-seq的最新综述，感兴趣的话值得一读。2020.4.22更新：我看到一个公众号也翻译了这篇文章，而且正好跟我这篇翻译是在同一天发表http...
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用泊松分布解释 NGS 测序数据的 duplication 问题
tags： NGS duplication 不管从哪个角度看我们都希望测序仪产出的数据中 duplicate 率尽量低。怎样降低 duplicate 率？ 构建文库时，核酸提...
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讨厌又迷人的reads去重复在NGS分析入门阶段，我们不需要考虑太多的细节，只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节，只会让我们对于分析产生莫须有的恐惧，因此一些“无关紧要“细节就被我们刻...
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生信坑底躺着不动的男人<br>简书不常在，有问题可私信
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生信工作者。
