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fastq、fasta、bed、gtf、gff、sam、bam生信分析常见文件格式查看生信分析过程中的文件格式：除了原始测序数据fastq、fasta之外，还有基因组文件fasta格式，基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如bed、...
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记录NCBI下载基因组的大坑写在前面 最近分析的物种由于国外品种与国内品种差异还是比较大，虽然大部分文章用的参考基因组都是以国外品种为主，但是由于考虑到目前我这边数据几乎全部都是来源于国内品种，因此在考...
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RNASeq实战练习-hisat2比对与featurecounts定量
hisat2 构建索引 hisat2 比对 hisat2 比对软件将 reads 比对到参考基因组[https://www.jianshu.com/p/e9cebbd8ef5...
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基因家族分析3 || 蛋白性质和序列分析基因家族流程：基因家族分析（一） 基因家族流程：基因家族分析（二） =====================================================...
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6、无重复差异基因分析（edgeR包的使用）1）简介 edgeR作用对象是count文件，rows 代表基因，行代表文库，count代表的是比对到每个基因的reads数目。它主要关注的是差异表达分析，而不是定量基因表达...
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GeneiASE —— ASE检验
在ASEReadCounter完成位点的覆盖度信息计数统计之后，还需要对位点添加基因ID，随后做二项分布和费舍尔精确检验，这里推荐GENEiase软件。 ASE （等位基因特...
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HZAU植科院农学本科毕业生<br>HZAU信息学院生信专业硕士毕业生<br>目前就职于国内某知名药企数据分析岗位<br>主要擅长SAS,R,Python,Linux,Shell,Power BI,Power automatic<br>对爬虫、网站搭建感兴趣<br><br>欢迎一起讨论呀~<br>简书不定时查看，有需要欢迎知乎私信:<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fcao-kai-30-84" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/cao-kai-30-84</a>
