16SrRNA 基因通常作为分子标记进行微生物群落结构的研究，但是它有一些明显的限制，比如16S rRNA基因在物种中会有多个拷贝，而且，由于16S rRNA基因的进化速率较...
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Fungene分析流程比较以nifH为例 -
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您好，用figaro分析截断位置所用的数据是未去除引物序列的，而dada2处理的是去除引物的，这个截取位置会不会变化？
一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)
之前写过一系列qiim2的教程都是零零散散的记录，里面也有不少命令打错的步骤给各位小伙伴造成了不少的疑惑，恰逢qiime2-2020.11发布，所以就在重新总结一次，这次稍后...
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Enterotypes of the human gut microbiome德国海德尔堡发表在Nature上的第一篇肠型分析 对于人类肠道微生物的了解快速增长，但是这些认识仍是基于很少一部分的人群的，世界范围上的差异并不清楚。从来自四个国家的22个分...
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NG | 孟德尔随机分析菌群&代谢物因果关系文章标题：Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabo...
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2019-02-13批量将文件以文件夹名字命名
运用SPAdes拼接完细菌基因组候，拼接完的结果保存在OutFileName/contigs.fasta，通常需要重命名然后下载到本地计算机进一步分析。在样本多的情况下，批处...
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review-肠道菌群与不健康衰老：区分原因与后果summary 现状： 1.肠道菌群会随着年龄改变，但是这种变化是由于生理变化、免疫衰老、炎症、饮食、药物还是长期的健康情况引起的尚不明确 2.发现肠道菌群与长寿人群有密切关...
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教你画一个掰弯的热图（Heatmap），展示更多的基因表达量难道，这不像孔雀开屏吗？ 写在前面 组学数据已经泛滥，但是信息的挖掘仍任重道远。顺手的工具，可以节省使用者尽可能多的时间，或者将看起来很复杂，很难以完成的事情，变得非常简单。...
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
