最近在搞基因组，前面contig的组装难度不大，用wtdbg2、raven、mecat2、flye等组装就可以了。 组装完毕后，contig挂载成染色体，可以采用高密度遗传连...
发简信
IP属地：海南
-
利用Juicer v2.0挂载染色体
-
BWA比对及Samtools提取目标序列
今天想看一下自己的序列里面会不会有某细菌基因组存在，主要使用BWA和Samtools： bwa主要用于将低差异度的短序列与参考基因组进行比对。主要包含三种比对算法：backt...
-
「基因组」hifiasm重大更新：支持Utralong ONT数据组装
hifiasm下载地址 截止今天为止，hifiasm官网更到0.19.3版本(五天前更新！！！)：https://github.com/chhylp123/hifiasm/r...
-
-
基于3D-DNA，ALLHiC挂载二倍体基因组关于3D-DNA，前面已经有简单介绍，本次主要介绍ALLHiC分析流程 ALLHiC的流程主要分为以下5个步骤： Prune: 修剪（二倍体基因组可以不用） Partitio...
-
T2T基因组的研究进展
基因组研究发展进程 1）1.0时代：使用二代测序，组装得到的是draft genome， 特点是组装完整性比较差的非染色体水平的基因组 2）2.0时代：使用的测序策略是PB（...
-
从拟南芥的T0123代获得纯合株系，转基因必经之路！作为模式生物，拟南芥（Arabidopsisthaliana）主要有以下几方面的优势： 第一，拟南芥的基因组在常见的植物模型中是最小的，染色体数目也很少，只有五对同源染色...
-
-
浅谈多倍体概念以及多倍体形成的几种途径多倍体，拥有三套及三套以上完整染色体组的生物体。 根据多倍体是否经历或已经完成二倍体化，可以将多倍体分为古多倍体 (paleopolyploid) 和近多倍体 (neopol...
