Phytozome 作为专门收录植物基因组的网站,在基因组数据的下载、查询、可视化浏览等方面做的都很不错。为了下载整个Phytozome数据库，我先后使用了requests库...
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使用Python3下载Phytozome数据库
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外显子、内含子、mRNA,CDS区别关于基因理论知识补充：外显子、内含子、mRNA,CDS区别 1、DNA复制：以DNA为模板，在DNA聚合酶的催化作用下，将四种游离的dNTP按照碱基互补配对原则合成新链DNA...
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[转载]清晰易懂的NGS原理和流程
1 测序技术2FASTA和FASTQ3数据质控4构建WGS主流程理解并操作BAM文件 GATK4.0和全基因组数据分析实践（上）GATK4.0和全基因组数据分析实践（下） 癌...
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我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
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#! /bin/bashbackground 你可能经常会在一个shell script file(.sh文件)，或者一个写满shell scirpt的text文件的开头看到这样一行代码： 为什么要...
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通过blast在基因组中找相似序列人类基因组中存在大量的重复区域，给定一段序列，如何知道这段序列在基因组中是否具有唯一比对，或者具有多个比对？ 一种方法是通过bwa，通过AS和XS 标签判断是否有次优比对；但...
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GFF文件和基因组文件提取mRNA,cds,protein序列首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 注意用bedtools提取序列，要加-s 参数（能区分正反链...
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CRISPR-Cas9基因编辑技术简介CRISPR-Cas9是继ZFN、TALENs等基因编辑技术推出后的第三代基因编辑技术，短短几年内,CRISPR-Cas9技术风靡全球, 成为现有基因编辑和基因修饰里面效率最...
