Phytozome 作为专门收录植物基因组的网站,在基因组数据的下载、查询、可视化浏览等方面做的都很不错。为了下载整个Phytozome数据库,我先后使用了requests库...

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关于基因理论知识补充:外显子、内含子、mRNA,CDS区别 1、DNA复制:以DNA为模板,在DNA聚合酶的催化作用下,将四种游离的dNTP按照碱基互补配对原则合成新链DNA...
1 测序技术2FASTA和FASTQ3数据质控4构建WGS主流程理解并操作BAM文件 GATK4.0和全基因组数据分析实践(上)GATK4.0和全基因组数据分析实践(下) 癌...
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年,我开始自学生物信息,那个时候,为了加深自己学习,所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客,xu...
前言 之前针对WorkerHub小程序做的数据分析文章 互联网卷王花落谁家?[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2Mjc0ODk1Ng=...
background 你可能经常会在一个shell script file(.sh文件),或者一个写满shell scirpt的text文件的开头看到这样一行代码: 为什么要...
人类基因组中存在大量的重复区域,给定一段序列,如何知道这段序列在基因组中是否具有唯一比对,或者具有多个比对? 一种方法是通过bwa,通过AS和XS 标签判断是否有次优比对;但...
首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 注意用bedtools提取序列,要加-s 参数(能区分正反链...
CRISPR-Cas9是继ZFN、TALENs等基因编辑技术推出后的第三代基因编辑技术,短短几年内,CRISPR-Cas9技术风靡全球, 成为现有基因编辑和基因修饰里面效率最...