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这篇文章是单细胞转录组（scRNAseq）和TCRseq联合分析的一个综述，介绍了目前关于这两种数据联合分析的最新进展(2022年)。 1. 介绍 1.1 T细胞受体的作用 ...

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一般画森林图的forestplot包需要大家把格式整理成其需要的“标准格式”，笔者最早学习绘制森林图的时候也是利用的forestplot包，每次都需要把计算出来的数据进行“二...

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花花写于2020-01-15 本文是根据感兴趣的基因或条件构建模型，并用于预测，可视化的图就是风险森林图了。更新于1.27 有两句cbind代码中变量名写错，已更正。 1.准...

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1.箱线图 Box plots 1.1 语法 geom_boxplot( mapping = NULL, data = NULL, stat = "boxplot", pos...

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TCGAbiolinks包是一站式分析TCGA数据的R包工具，它集成了TCGA数据下载、分析、可视化的全部流程。此次系列笔记主要跟着 TCGAbiolinks帮助文档重新学习...

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30、第三十计 反客为主本是客人却用主人的口气说话。后指在一定的场合下采取主动措施，以声势压倒别人。 代码框较乱，点这里阅读原文[https://cloud.tencent....

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标题党，这个是总目标。 蛋白质高通量鉴定，目前主要就是通过质谱，依靠已知的蛋白库，坑蒙拐骗猜，猜对了是运气，猜错了是原理问题，运气运气。一直很头疼这个问题，如果可以让蛋白质检...

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今天的推文继续学习A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with severe ...

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相关性分析 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程...

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简介：相关图是基于相关系数矩阵绘制的图。通常是将1个变量映射到多个视觉元素，所以看起来很花哨。如果是椭圆： 则椭圆的色相对应相关性的正负， 颜色深浅对应相关性绝对值大小，越深...

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前言 一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能，需要做个富集分析。虽然公司买了最新版的数据库，如KEGG，但在集群跑下来嫌麻烦。这时网页在线或者本地化工具派上用场了。...

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作者：白介素2相关阅读：R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr...

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在文献中，我们经常能够看到这样的散点图。例如，通过RNA-seq或qPCR比较特定基因在不同分组样本中的整体表达水平。 与其称它们为散点图，其实它们是有独自名字的—蜂群图。当...

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这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】：基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化：总述和分文目录 【ggplot2绘图具体...

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作者：白介素2相关阅读：R语言ggplot2绘制箱线图R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR...

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使用VennDiagram包绘制韦恩图 加载所需R包 绘制一维韦恩图 绘制二维韦恩图 绘制三维韦恩图 绘制四维韦恩图 绘制五维韦恩图

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deepTools 是一套基于python开发的工具，适用于有效处理分析高通量测序数据，可用于ChIP-seq, RNA-seq 或 MNase-seq。 #1. deepT...

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参考：碱基矿工从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第4节 构建WGS主流程GATK4.0和全基因组数据分析实践（上） 前言 由于人类基因组数据过大（我的小小服务器也只有50...