找到Matrix eQTL这个包,看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations(...
请问博主有更好的办法么,我跑了下代码,只匹配了很少一部分
无痛解决基因全称与缩写的转换“山穷水尽疑无路,柳暗花明又一村” 某天,想收集一类药物的作用靶点,上了Drugbank获取了全部数据,加载到R中,解析出来后蒙圈了,它居然一个基因靶点对应了多个名称。这就很...
@ScorpioGirll 好的,现在了解啦,谢谢!
小鬼的WGCNA图文详解(四)-模块与性状相关性 图还是老习惯,给出官网教程,至于你是看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coexpress...
期待后续!
小鬼的WGCNA图文详解(七)-eigengene network的可视化WGCNA图文详解(七)-eigengene network的可视化 还是老习惯,给出官网教程,至于你是看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~ https://horva...
“临床表型转换为数值的trait的时候,直接涉及到了后面相关性的计算:”所以想请教一下,是不是比如不同疾病,就其他分类变量就改成1和0就好,可以改成10或0么,或100与0,这样会影响相关性结果么,谢谢您!
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写在前面,这篇文章主要整理自于Gene co-expression analysis for functional classification and gene–disea...
The Connectivity Map, or CMap, is a resource that uses cellular responses to perturbati...
Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代码,实现了导出gene2module 目的 最近有个项目又准备跑WGCNA,之前跑通过一个,然后很久没碰,...
主要简单总结省心的工具,具体用的时候再查就好。 替换功能 善用星号(*),问号(?),连接文本(&)示例:有两个大组数据,每组数据均有两列,对其整体取交集,各组两列分别为;"...
本来觉得转录组上游暂时先不用学习,但是在处理原始数据时候,发现下载后,需批量处理样本,解压缩,及修改文件名。批量处理?欸,可以用LINUX,去百度了以下方法,待更新; 继续百...