看了这个之后，对作者肃然起敬
从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第4节 构建WGS主流程这篇文章很长，超过1万字，是本系列中最重要的一篇，因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读，对于有一定经验的老手来说，相信依然可以有...
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aria2（命令行下载器）使用
aria2 是一个自由、开源、轻量级多协议和多源的命令行下载工具。它支持 HTTP/HTTPS、FTP、SFTP、 BitTorrent 和 Metalink 协议。aria...
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【哈佛大学：计算生物学 & 生物信息学】学习记录（三）局部比对算法 —— Smith-Waterman Algorithm Swimt-Waterman算法本质上是一种Dynamic Programming（动态规划算法），和N...
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RcisTarget || 从基因列表到调控网络单细胞技术正在加强我们对细胞本身的理解。什么是细胞类型，不就是基因选择性表达的结果吗？而基因的选择表达受到一系列的转录调控，在这个意义上，细胞命运背后的驱动力在于各自转录因子...
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简单了解蛋白质互作网络(PPI)蛋白质互作网络（PPI） 蛋白质互作网络（Protein-Protein Interaction Networks，PPI）是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成，来参与生物信号...
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meshes包加载报错
在加载meshes包的时候出现了下面的报错： library(meshes) Error: package or namespace load failed for ‘mes...
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您好，非常感谢您写了这篇文章，在这里，我有一个疑问，就是identifyDistal3UTR运行之后生成的结果文件里面Gene symbol为什么都是NA
APAtrap的使用
网站：https://sourceforge.net/projects/apatrap/ 说明书：https://sourceforge.net/p/apatrap/wiki...
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获取基因组的bed、gtf注释文件先来看一下常见的基因组注释格式 bed gtf gff 需要特别注意的是，bed的每一行记录是左闭右开区间，并且以0作为染色体的起始；而gtf的每一行记录是包括区间的两端的，...
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当样本的重复数不相等时，用DESeq2怎么进行差异分析总的实验设计（实验组与对照组以及样本的重复数） 使用DESeq2进行基因表达的差异分析 绘制PCA plot 和heatmap以及对结果提取差异分析的结果 不同的组之间的差异...
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我用到的Samtools介绍记录一下我用到的samtools的用法。 samtools的说明文档：http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml[http:...
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Windows下更新R版本及RstudioWindows下更新R版本及Rstudio 今天在下载APAlyzer这个包的时候一直不成功，提示了各种错误，然后去bioconductor查看了一下APAlyzer的安装，...
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ggplot2笔记——初步摸索ggplot2笔记里面采用的是R里面内置的数据集进行画图的，数据的结构比较简单你，便于理解。笔记参考的图书是《数据分析实战 》by 【美】托马兹·卓巴斯（Tomasz Dra...
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