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RNA-Seq：从fastq到表达矩阵一、测序数据的准备 新建工作目录，RNASeq-analysis mkdirRNASeq-analysiscdRNASeq-analysis/ 新建data文件夹； mkdi...
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小试牛刀——学会开Seurat函数“盲盒”
水有源，故其流不穷；木有根，故其生不穷。 长期以来，我们的单细胞分析仅仅停留在调包、套函数、……，这个过程会“蒙住”我们的眼睛，有些时候我们需要知道每个函数究竟在干什么才能够...
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文献阅读007|CD47-Sirpa和IL10相互作用抑制炎症巨噬细胞对健康自体细胞的吞噬待解决的科学问题： 1. CD47/Sirpa KO为什么不会影响小鼠生长发育？（如果巨噬细胞主要借助CD47/Sirpa来区分非我） 因为除了CD47/Sirpa通路外，还...
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Cre-LoxP条件性基因编辑系统--学习笔记背景 Cre/LoxP系统来源于F1噬菌体，是非常经典有效的基因编辑技术。 1. 什么是Cre Cre重组酶(cyclizationrecombination)，它是一种由3...
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与致病癌症相关的代谢通路
1. Akt/PKB Signaling Pathway Akt也被称为蛋白激酶B(protein kinase B，PKB)，是一种分子量约为60kDa的丝/苏氨酸蛋白激酶...
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文献阅读004|IRG1靶向可以抑制TAM的免疫抑制功能从而增强肿瘤免疫疗法Background IRG1——encodes the metabolic enzyme aconitate decarboxylase (ACOD1) that cata...
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文献阅读002|PD1/PD-L1的发现与研究Nature, 2006 1.PD-1 is upregulated during chronic viral infection acute/chronic infecti...
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文献阅读001|Stat抑制Tox逆转T细胞耗竭Stat5 opposes the transcription factor Tox and rewires exhausted CD8+ T cells toward du...
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CITE-seq：同时测细胞表面蛋白和RNA的单细胞测序单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
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