刘小泽写于2020.2.6最近再一次做起了转录组，但这一次需求有点小改变，需要自己定制一下，具体原因看本文吧。其中要特别表扬花花💏同学，帮了个大忙！ 问题由来 我们一般进行富...
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一个看似简单的需求——修改富集分析的dotplot图 -
单细胞转录组学习笔记-12-RPKM概念及计算方法刘小泽写于19.7.9+12-第二单元第十讲：RPKM概念及计算方法笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在：http:...
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ensembl_id转换之两种方法比较
一个基因在不同的数据库有不同的名字：1.Entrez gene ID：我们一般说的Gnen ID即Entrez gene ID，是用一串数字表示的（在NCBI里面用）2.Ge...
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技能帖 | 基因ID和基因名如何快速互换，三分钟即可做到
在我们进行组学数据分析或者看别人给我们的数据报告的时候，经常会看到诸如ENSG00000141738 之类的名称，面对这样的名称，我们往往是得不到任何信息的，更不可能把这样的...
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Stringtie的使用说明
参考文献：stringtie enables improved reconstruction of a transcriptome from rNA-seq reads帮助文...
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单细胞分析——如何确定合适的分辨率（resolution）水滴石穿，非一日之功 本期内容同时发布于单细胞天地微信公众号。 在进行单细胞分析时，非常重要的一步就是聚类分群，而在这个过程当中经常令人困惑的是如何选择一个合适的分辨率（re...
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单细胞 | Seurat文件生成最近想使用文献中的数据集，发现每篇文献提供的数据格式都不太一样，创建seurat对象会遇到一些问题。以标准的输入文件为例，命名为barcodes.tsv.gz、feature...
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FastQC数据质控报告的详细解读
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 测序平台编号，现在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33编码 Total sequ...
