刘小泽写于2020.2.6最近再一次做起了转录组,但这一次需求有点小改变,需要自己定制一下,具体原因看本文吧。其中要特别表扬花花💏同学,帮了个大忙! 问题由来 我们一般进行富...

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刘小泽写于19.7.9+12-第二单元第十讲:RPKM概念及计算方法笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在:http:...
一个基因在不同的数据库有不同的名字:1.Entrez gene ID:我们一般说的Gnen ID即Entrez gene ID,是用一串数字表示的(在NCBI里面用)2.Ge...
在我们进行组学数据分析或者看别人给我们的数据报告的时候,经常会看到诸如ENSG00000141738 之类的名称,面对这样的名称,我们往往是得不到任何信息的,更不可能把这样的...
参考文献:stringtie enables improved reconstruction of a transcriptome from rNA-seq reads帮助文...
水滴石穿,非一日之功 本期内容同时发布于单细胞天地微信公众号。 在进行单细胞分析时,非常重要的一步就是聚类分群,而在这个过程当中经常令人困惑的是如何选择一个合适的分辨率(re...
最近想使用文献中的数据集,发现每篇文献提供的数据格式都不太一样,创建seurat对象会遇到一些问题。以标准的输入文件为例,命名为barcodes.tsv.gz、feature...
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 测序平台编号,现在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33编码 Total sequ...