使用二代数据或三代数据得到contig后，下一步就是将contig提升到染色体水平。对于二倍体物种而言，目前3D-DNA应该是组装效果最好的一个软件。 一：工作流程 使用3D...
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利用3D-DNA挂载基因组 -
Linux下source ~/.bashrc的含义
source ~/.bashrc 其中~代表当前用户的主目录。普通用户就是/home，root用户就是/root。想要具体看当前用户的主目录，可以通过以下方式： cd ~ p...
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误删/清空.bashrc文件/内容误删.bashr或者清空.bashrc怎么办 遇到这种情况不要慌，问题不大，不要乱操作，赶紧百度。 今天我本想追加一个环境变量。然后呢，少了个>，$PATH我用了下面类似这命...
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Linux下profile和bashrc区别
1./etc/profile用来设置系统环境参数，比如$PATH. 这里面的环境变量是对系统内所有用户生效的。 2./etc/bashrc这个文件设置系统bash shell...
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软件7 —— bowtie和bowtie2
一、 基本介绍 (1) DNA-seq和RNA-seq 基因组测序（DNA-seq）和转录组测序（mRNA-seq）的区别在于，真核生物的RNA经过剪接后，序列与DNA序列...
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基于blast进行GO功能注释
目前GO注释主要分为两种方法，其一，序列相似性即blast，其二，结构域相似性比对（InterProsScan），该方法在前面也提及过，本文就blast进行简要概述 所需文件...
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hisat2比对软件将reads比对到参考基因组
转载：https://biozx.top/hisat2.html[https://biozx.top/hisat2.html] HISAT2是TopHat2/Bowti2的继...
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转录组组装新方法 - HISAT, StringTie and Ballgown最近在做转录组数据分析，看到了nature protocol上8月11最新发的转录组分析新流程的文章，拿出来和大家分享，自己也准备好好研究研究，希望对自己以后的分析有所帮助。...
