一、背景介绍 通常,BED文件的overlap/intersect的操作,可以BEDtools intersect功能完成overlap和统计:Bedtolols inter...

一、背景介绍 通常,BED文件的overlap/intersect的操作,可以BEDtools intersect功能完成overlap和统计:Bedtolols inter...
前言 我们知道,细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用,另一个通过细胞产生的可溶性小分子,即细胞因子。在单细胞数据分析中下游,有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...
Ensembl 对于学习生物信息学的我们来说应该是如数家珍了,但是我们平时常用到的操作一般是去查基因,下载基因组,这些都是通过网页端来完成: http://uswest.en...
一、安装 Conda 安装使用图文详解(2021版)[https://blog.csdn.net/u011262253/article/details/88828229] s...
写在前面的废话 我可能不适合做科研,因为我总是对一些“没有必要”的事斤斤计较~ 刚开始接触二代测序时,是跟着Jimmy大神从RNA-seq开始入门的。那时候使用的比对工具是H...
数据分析插件 1、进入 Excel 点击选项 2、在加载项中点击转到 3、打开分析工具库扩展 4、选择数据标签页,点击数据分析 5、选择适合数据的分析方法,这里以方差分析为例...
一、测序原理 先介绍 Nanopore 测序中的几位主角: Reader :在自然界中,有一种可以嵌入到细胞膜中作为离子或分子通道的跨膜蛋白,具有天然的蛋白纳米孔。经过人为基...
一、命令 格式:scp 文件/目录路径名 root@ip地址:文件/目录路径名 1、从远程服务器复制文件到本地 2、从本地文件复制到远程服务器 3、从远程服务器复制目录到本地...
一、介绍 ChIP-seq,测序方法ChIP 指染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),seq 指的是二代测序方法 作用...
以Targeting super-enhancer-associated oncogenesin oesophageal squamous cell carcinoma为例,...
正态分布介绍 这是在统计学中大名鼎鼎的一种分布,最早由德国的天文学家Moivre提出。 后来,德国数学家高斯(Gauss)首先将其应用于天文学研究,故正态分布也叫“高斯分布”...
0.需求解读 这是富集分析比较常见的一个图,左图右表。 图的最外层是GOterm的编号,中间灰色背景层表示基因的logFC分布,可以看到每个term对应到的市上调基因还是下调...