全基因组关联分析(GWAS)大家都不陌生,今天我们给大家介绍下各种格式之间转化在R语言是怎么实现的。首先我们来看下GWAS都有哪些数据格式: 1. HapMap格式,这也是当...
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What are variants, alleles and haplotypes? What are variants? In the field of genetic v...
混合线性模型 我们说的混合线性模型主要是由固定效应和随机效应所构成的,固定效应是我们主要研究的影响因素,而随机效应是潜在的,影响固定效应的因素。对于混合线性模型来说,随机效应...
如何从转录组数据中筛选候选基因 前言 转录组分析的最重要目的之一就是筛选候选基因,需要从转录组数据中筛选出跟研究相关的一个或几个候选基因。筛选候选基因的核心是“基因集GSA”...
表达数量性状位点(expression quantitative trait locus, eQTL)是一类能够影响基因表达量的遗传位点(大部分都是单核苷酸多态性,SNP),...
1 关键细胞类型或Marker缩写: 骨髓多能造血干细胞 HSC 淋巴样祖细胞 lymphoid progenitor cell T细胞抗原识别受体 TCR 抗原提呈细胞 A...
单细胞测序方法和原理系列: 1. 单细胞转录组建库原理:SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
3背景 抗生素的耐受性与抗生素治疗失败以及许多细菌感染的复发相关。并且与耐药性不同,它需要使用MIC法进行测量,由于一种相似定量分析指标的缺乏,耐受性成为一种特征比较模糊的指...
得益于曾老师的介绍引导,了解此包。了解一个包,先看包的说明书,包的用法都在里面。maftools包说明书 1.安装包,加载包 source("http://bioconduc...