最近在学习一篇群体转录组和eQTLs相关的文献，做一个简单的笔记。该论文分析了287份材料的转录组数据，并在一个远端eQTL调控热点中鉴定到一个关键转录因子，它能够激活下游抗...
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文献解读丨利用群体转录组方法和eQTLs寻找水稻抗病转录因子 -
post-GWAS era文章分享3-From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Un...概览 Title：From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Un...
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泛基因组分析-基本流程代码以下是自己使用map-to-pan分析泛基因组的部分代码，仅供参考:统计fasta序列的N50、N90以及最短、最长序列 现在需要筛选大于500bp的序列做后续分析: 再写个...
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真核生物基因结构图（外显子、内含子、mRNA、CDS区别）1. 基因DNA分为编码区和非编码区，编码区包含外显子和内含子，一般非编码区具有基因表达的调控功能，如启动子在非编码区。编码区则转录为mRNA并最终翻译成蛋白质。外显子和内含...
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fastp全新的数据质控软件各位做生信的小伙伴都知道，对于下机的FASTQ数据需要进行质控和预处理，以保证下游分析输入的数据都是干净可靠的。通常我们都是使用FASTQC等软件进行质控，使用cutadap...
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祖先状态重建—揭示物种性状的起源与演化我觉得处理任何事情，不仅要做到“知其然”，还要做到“知其所以然”。在做事情时，如果仅知道低头蛮干，不知道抬头看路；只知道跟着“牵牛绳”的方向，在鞭子的抽打下前进或停止，那么最...
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ggplot2优雅的绘制饼状热图欢迎关注R语言数据分析指南 最近看到一张非常有意思的图，暂且称之为饼状热图,与corrplot所绘制的有所不同此图使用的为离散型变量，例图如下所展示；由于作者未提供原始数据，...
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2022《Cell》 作物驯化与育种中的整合基因组学导读 野生植物被成功地驯化为农作物是人类文明的大事件。该过程的成功很大程度上要归功于持续的人工选择。本文总结了过去十年在作物驯化和育种研究中的新发现。作物基因组图谱的构建和众...
