0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来,后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控:fastp[https://git...
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分子对接分析是基于受体与配体在氢键、疏水键、空间结构等相互作用规律的基础上,预测分子间亲和力及结合模式,实现基于分子结构的药物设计和筛选的一种重要方法。下面详细介绍一个实例:...
刘小泽写于18.7.29 写在前面:之前介绍过文本处理的三剑客,grep、sed、awk,也曾说过,学了awk,让一切字符秒变尴尬“awk word”。其中的awk可以说是独...
头大 看了几个不清楚的定义把我搞混了 正确清晰的定义 https://en.wikipedia.org/wiki/Untranslated_region和 I think t...
本文应该是第二全的WGCNA分析教程,参考了最新的文档。第一全的还在路上,会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上,欢迎点击链接了解更多。 WGC...
R语言如何多线程 相对于python或者perl来说,R给我的感觉是速度不是太快,有时候部分程序是可以用多线程进行并行运算的。 这里介绍一个包parallel。 方法1: p...
前言 使用 pheatmap 已经能够绘制满足大多数要求的聚类热图了。 受 pheatmap 包的启发,ComplexHeatmap 提供了对热图更多更灵活的控制,如多数据热...
导读 BPGA是Bacterial Pan Genome Analysis tool的简写,16年发表的工具,17年最后一版更新,内置KEGG COG数据(老了),依赖use...
今天我们要来介绍在16S分析中经常用到的另一个在线分析工具LEfSe。该工具是由Huttenhower小组开发的,用于通过相对丰度来发现2个或更多个组之间的生物标记。本节主要...