单细胞数据标准分析Seurat流程: Seurat官网:https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...
IP属地:辽宁
单细胞数据标准分析Seurat流程: Seurat官网:https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...
常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]:是公开的人工校正的,储存受体、配体以及两种相互作用...
1. 为什么我们要进行Normalization 测序深度:某些低表达量的基因只有在较高的测序深度时才能检测到。一般而言,随着测序深度的增加,基因种类以及可变剪接体的数目也会...
R语言基础系列: R语言基础1--R数据格式:.rds和.rda的区别[https://www.jianshu.com/p/6a824548887b] R语言基础2--数据排...
这篇综述今年6月1日发表在Journal of the American Society of Nephrology[IF=9.274]上。 在过去的5年里,单细胞方法使得能...
AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集(如gene signature,gene module)的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...
基因表达趋势分析-1:TCseq[https://www.jianshu.com/p/b808085c7351] Mfuzz能够识别表达谱的潜在时间序列模式,并将相似模式的基...
单细胞绘图系列: Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...