水木的编程那些事儿

一、PWM与PFM的介绍 motif指的是转录因子偏好结合的DNA序列模式或RNA结合蛋白偏好结合的序列模式，一般使用PWM来表示motif。 制作PWM的过程如下： 首先计...

生信师姐

随着基因组测序爆炸性增长，比较基因组学已逐渐成为每个物种尤其是首次被破译基因组的物种的必备研究内容之一。那么什么是比较基因组学呢？比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之...

郝永超M1racle

最近用Orthofinder做物种进化树，最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大，在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的，然后跟老师...

一只烟酒僧

参考文献：Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie ...

生信宝典

本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGC...

小潤澤

网络图 在传统的网络图里面，一般分为非权重网络和权重网络对于非权重网络： 非权重网络的特点是只能表示两个点之间是否有关系，单纯的“一刀切”，即只有“有关系”和“无关系”这两种...

夏大希

参考文献High-resolution spatiotemporal transcriptome mapping of tomato fruit development an...